[发明专利]基于电化学技术的小分子-DNA结合常数计算方法在审
申请号: | 202310054338.4 | 申请日: | 2023-02-03 |
公开(公告)号: | CN115950937A | 公开(公告)日: | 2023-04-11 |
发明(设计)人: | 李静 | 申请(专利权)人: | 中国科学院地理科学与资源研究所 |
主分类号: | G01N27/327 | 分类号: | G01N27/327;G01N27/48 |
代理公司: | 北京慕达星云知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11465 | 代理人: | 田立媛 |
地址: | 100101 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 电化学 技术 分子 dna 结合 常数 计算方法 | ||
1.基于电化学技术的小分子-DNA结合常数计算方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)制备DNA修饰电极:
将末端功能化的DNA制成溶液,涂于电极界面,交联孵育后清洗、吹干,得到DNA修饰电极;
(2)测定电化学信号:
测定所述DNA修饰电极的电化学信号S1;
取污染物小分子制成不同浓度溶液,将所述DNA修饰电极浸泡于污染物小分子溶液中进行孵育;孵育后DNA修饰电极清洗、吹干,测定电化学信号S2;
计算各浓度污染物小分子溶液孵育前后DNA修饰电极的电化学信号变化值Sw=|S2-S1|;
(3)确定污染物小分子检测浓度:
根据电化学信号变化值最大值SC,确定电化学信号变化值为SCK的污染物小分子溶液浓度Ck为测定污染物小分子与DNA结合常数的检测浓度;SCK/SC>0.70;
(4)构建标准曲线:
选择结合常数已知的不同污染物小分子,分别配置成浓度为Ck的溶液,按步骤(2)方法测定电化学信号,计算电化学信号变化值;根据结合常数与电化学信号变化值绘制标准曲线;
(5)测定结合常数:
配置浓度为Ck的待测污染物小分子;按步骤(2)方法测定电化学信号,计算电化学信号变化值,结合标准曲线计算结合常数。
2.根据权利要求1所述的基于电化学技术的小分子-DNA结合常数计算方法,其特征在于,
步骤(1)中,
末端功能化的位点在DNA的5’端或3’端;
功能化官能团包括氨基、羧基、醛基、巯基。
3.根据权利要求1所述的基于电化学技术的小分子-DNA结合常数计算方法,其特征在于,
步骤(1)中,
所述DNA为hairpin DNA,其中双链stem部分的碱基对数不少于5。
4.根据权利要求1所述的基于电化学技术的小分子-DNA结合常数计算方法,其特征在于,
步骤(1)中,
所述电极为经活化处理的金电极、玻碳电极、碳电极或丝网印刷电极;
所述活化处理包括酸溶液活化、碱溶液活化、盐溶液活化和/或电化学活化。
5.根据权利要求1所述的基于电化学技术的小分子-DNA结合常数计算方法,其特征在于,
步骤(1)中,
交联孵育使用的交联剂为三(2-羧乙基)膦盐酸盐、二环己基碳二亚胺、碳酰二亚胺或N-羟基硫代琥珀酰亚胺;
孵育时间为10-120min。
6.根据权利要求1所述的基于电化学技术的小分子-DNA结合常数计算方法,其特征在于,
步骤(2)中,
采用三电极测定体系测定电化学信号;
以污染物小分子溶液孵育前后DNA修饰电极作为工作电极,铂丝电极作为对电极,银/氯化银电极作为参比电极;
测定方法包括电流法、电位法或电阻法。
7.根据权利要求6所述的基于电化学技术的小分子-DNA结合常数计算方法,其特征在于,
步骤(2)中,
电解质溶液为PB、Tris、醋酸盐或碳酸盐缓冲溶液,浓度为1-200mM,pH6.0-8.0;
测定电信号所用指示物质为K3[Fe(CN)6]和K4[Fe(CN)6]。
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