[发明专利]牛昏睡嗜血杆菌的荧光定量PCR检测试剂盒及其专用引物和TaqMan探针在审

专利信息
申请号: 202310058873.7 申请日: 2023-01-18
公开(公告)号: CN116219044A 公开(公告)日: 2023-06-06
发明(设计)人: 徐丽媛;刘建奇;邬彩丽;李劼;刘玉梅;班亚星;刘东霞;范文霞;赵丽霞;关平原 申请(专利权)人: 金宇保灵生物药品有限公司
主分类号: C12Q1/689 分类号: C12Q1/689;C12N15/11;C12Q1/6851;C12R1/21
代理公司: 北京尚诚知识产权代理有限公司 11322 代理人: 叶占洋;鲁兵
地址: 010000 内蒙古自治区呼和浩*** 国省代码: 内蒙古;15
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摘要:
搜索关键词: 昏睡 嗜血 杆菌 荧光 定量 pcr 检测 试剂盒 及其 专用 引物 taqman 探针
【权利要求书】:

1.一种用于对牛昏睡嗜血杆菌进行荧光定量PCR检测的引物和TaqMan探针,其特征在于,

所述引物包括用于检测牛昏睡嗜血杆菌的上游引物Hs-F2和下游引物Hs-R2,其中所述上游引物Hs-F2包含如SED ID NO:4所示的核苷酸序列,所述下游引物Hs-R2包含如SEDIDNO:6所示的核苷酸序列;

所述TaqMan探针包括用于检测牛昏睡嗜血杆菌的探针Hs-P2,其包含如SED ID NO:5所示的核苷酸序列。

2.根据权利要求1所述的引物和TaqMan探针,其特征在于,所述TaqMan探针的5’端标记有荧光报告基团,3’端标记有荧光淬灭基团,且所述TaqMan探针的3’端已经磷酸化处理;可选地,所述荧光报告基团选自FAM、HEX、JOE、TET、CY3、CY5、ROX、Texas,所述荧光淬灭基团选自TAMRA、BHQ(BHQ1、BHQ2、BHQ3)、MGB、DABCYL。

3.一种用于对牛昏睡嗜血杆菌进行荧光定量PCR检测的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求1或2所述的引物和TaqMan探针。

4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括阳性对照品和阴性对照品,其中所述阳性对照品是含牛昏睡嗜血杆菌OmpA基因的重组质粒,所述阴性对照品为不含牛昏睡嗜血杆菌及其基因组DNA的组分,如DEPC处理水(双蒸水、去离子水等)。

5.根据权利要求3或4所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括标准品,所述标准品是含牛昏睡嗜血杆菌OmpA基因的重组质粒,其浓度选自1×1010、1×109、1×108、1×107、和1×106copies/μL。

6.一种用于对牛昏睡嗜血杆菌进行荧光定量PCR检测的非疾病诊断目的方法,其包括以下步骤:

(1)提取待测样品的基因组DNA,以提取的基因组DNA为模板,在权利要求1或2所述的引物和TaqMan探针的引导下进行荧光定量PCR检测;

(2)用步骤(1)得到的Ct值和出现的特异性扩增曲线对牛昏睡嗜血杆菌进行定性检测,和/或根据标准曲线和得到的Ct值,计算待测样品中所含牛昏睡嗜血杆菌核酸的拷贝数,实现定量检测。

7.根据权利要求6所述的方法,其中步骤(2)中所述标准曲线的绘制方法包括以下操作:将牛昏睡嗜血杆菌标准品按照10倍梯度稀释至浓度1×106、1×105、1×104、1×103、1×102、1×101copies/μL,得到不同浓度的标准样品;以不同浓度的标准样品作为模板,在权利要求1或2所述的引物和TaqMan探针的引导下进行荧光定量PCR检测,检测结束后,以各标准样品的浓度Log值(X轴)对其相应Ct值(Y轴)作图,绘制得到标准曲线。

8.根据权利要求6或7所述的方法,其中步骤(1)中所述荧光定量PCR检测的体系包含荧光PCR预混液,其包含:Hieff Unicon Universal TaqMan multiplex qPCR master mix10-15μL、10μM的Hs-F2 0.25-1.0μL、10μM的Hs-R2 0.25-1.0μL、10μM的Hs-P2 0.4-1.0μL、模板4-10μL;和/或

步骤(1)中所述荧光定量PCR检测的条件为:95℃预变性5分钟;PCR扩增95℃变性15秒,56℃延伸30秒,45个循环。

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