[发明专利]一组用于评估非小细胞肺癌风险的血浆miRNA标志物及其筛选方法和应用在审
申请号: | 202310063264.0 | 申请日: | 2023-01-16 |
公开(公告)号: | CN116083584A | 公开(公告)日: | 2023-05-09 |
发明(设计)人: | 郭欢;肖阳;管鑫;刘晨亮;孟华 | 申请(专利权)人: | 华中科技大学 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6809;G16H10/40;G16H50/30 |
代理公司: | 武汉楚天专利事务所 42113 | 代理人: | 邹舟 |
地址: | 430074 湖北*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一组 用于 评估 细胞 肺癌 风险 血浆 mirna 标志 及其 筛选 方法 应用 | ||
1.一组用于评估非小细胞肺癌风险的血浆miRNA标志物,其特征在于:包括miR-205-5p、miR-206、miR-4732-3p、miR-4732-5p和miR-12136中的任意一种或者五种组合。
2.如权利要求1所述的血浆miRNA标志物在制备用于非小细胞肺癌患病评估的miRNA标志物检测试剂中的应用。
3.如权利要求1所述的血浆miRNA标志物在制备用于非小细胞肺癌患病评估的试剂盒中的应用。
4.一组用于评估非小细胞肺癌风险的血浆miRNA标志物组合的筛选方法,其特征在于包括以下步骤:
(1)检测非小细胞肺癌患者和与患者年龄和性别相匹配的健康对照者的外周血样品中miRNAs,以及检测非小细胞肺癌患者术前、术后的血浆miRNAs count数据;
(2)对非小细胞肺癌患者和健康对照者的血浆miRNAs的count数据进行标准化,用多元线性模型在全基因组范围筛选与非小细胞肺癌有关联的miRNAs;
(3)采用DESeq2软件包进行匹配的差异分析,依据差异倍数2或0.5、Bonferroni方法多重校正的P值小于0.05的标准,筛选出术前相对于术后显著性差异表达的血浆miRNAs,从而验证出与非小细胞肺癌相关的血浆miRNAs;
(4)在不同病理分型的亚组分析中,依次按照与步骤(2)和步骤(3)相同的方法和标准,分别筛选出肺腺癌和肺鳞癌相关的血浆miRNAs,并进一步筛选出同时与肺腺癌和肺鳞癌相关的血浆miRNAs的组合。
5.根据权利要求4所示的用于评估非小细胞肺癌风险的血浆miRNA标志物组合的筛选方法,其特征在于:所述步骤(2)中以标准化后的miRNA数据为因变量,肺癌状态为自变量,校正年龄、性别、体质指数、吸烟状态、饮酒状态;依据Bonferroni方法多重校正的P值小于0.05的检验标准,筛选出具有显著性的非小细胞肺癌相关血浆miRNAs。
6.非诊断目的的血浆miRNA标志物评估非小细胞肺癌患病风险的方法,其特征在于:将检测如权利要求1所述的血浆miRNA标志物的表达水平与传统预测因素相结合。
7.如权利要求6所述的非诊断目的的血浆miRNA标志物评估非小细胞肺癌患病风险的方法,其特征在于:所述传统预测因素包括年龄,性别和吸烟状态。
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