[发明专利]g.55904G>A、g.55993T>C和g.56067G>A在湖羊分子标记辅助育种中的应用在审
申请号: | 202310064521.2 | 申请日: | 2023-01-16 |
公开(公告)号: | CN116219033A | 公开(公告)日: | 2023-06-06 |
发明(设计)人: | 单慧丽;姜俊芳;黄新;郑开之;曹阳 | 申请(专利权)人: | 浙江省农业科学院 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 杭州恒翌专利代理事务所(特殊普通合伙) 33298 | 代理人: | 王从友 |
地址: | 310022 浙江*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 55904 55993 56067 湖羊 分子 标记 辅助 育种 中的 应用 | ||
1.一种与湖羊胸围和/或初生重显著相关的SNPs分子标记,其特征在于,该分子标记定位为g.55904G>A、g.55993T>C和/或g.56067G>A;其中:
g.55904G>A与胸围,初生重显著相关,AA个体的胸围显著高于GA,GG个体,GG个体的初生重显著高于AA与GA个体;
g.55993T>C与胸围显著相关,CC基因型显著高于TT个体,与TC相比差异不显著,TT与TC相比差异不显著;
g.56067G>A与胸围,初生重显著相关,AA基因型的胸围显著高于GA与GG个体,GG与GA相比差异不显著,GG个体的初生重显著高于GA,AA个体,GA与AA相比差异不显著。
2.一种用于检测权利要求1中所述SNPs分子标记的引物对。
3.权利要求2所述的引物对扩增获得的扩增产物,该扩增产物的序列如SEQ ID NO:1或SEQ ID NO:2所示。
4.一种用于扩增权利要求3所述的扩增产物的引物对。
5.根据权利要求4所述的引物对,其特征在于,
扩增如SEQ ID NO:1序列的产物,引物对的序列如SEQ ID NO:3 和SEQ ID NO:4所示;
扩增如SEQ ID NO:2序列的产物,引物对的序列如SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6所示。
6.一种包含权利要求2或4或5所述引物对的试剂盒。
7.权利要求1所述的SNPs分子标记、权利要求2或4或5所述的引物对和权利要求6所述的试剂盒在筛选胸围和/或初生重性状和湖羊分子标记育种中的应用;其中:
g.55904G>A与胸围,初生重显著相关,AA个体的胸围显著高于GA,GG个体,GG个体的初生重显著高于AA与GA个体;
g.55993T>C与胸围显著相关,CC基因型显著高于TT个体,与TC相比差异不显著,TT与TC相比差异不显著;
g.56067G>A与胸围,初生重显著相关,AA基因型的胸围显著高于GA与GG个体,GG与GA相比差异不显著,GG个体的初生重显著高于GA,AA个体,GA与AA相比差异不显著。
8.一种筛选湖羊胸围和/或初生重性状的方法,其特征在于,该方法包括以下步骤:提取湖羊外周血基因组DNA,采用权利要求2或4或5所述的引物对进行PCR扩增,对扩增产物中权利要求1所述的SNPs分子标记进行检测,从而筛选出湖羊的胸围和/或初生重性状;其中:
g.55904G>A与胸围,初生重显著相关,AA个体的胸围显著高于GA,GG个体,GG个体的初生重显著高于AA与GA个体;
g.55993T>C与胸围显著相关,CC基因型显著高于TT个体,与TC相比差异不显著,TT与TC相比差异不显著;
g.56067G>A与胸围,初生重显著相关,AA基因型的胸围显著高于GA与GG个体,GG与GA相比差异不显著,GG个体的初生重显著高于GA,AA个体,GA与AA相比差异不显著。
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,PCR 反应体系为25 μL,KOD OneTM PCRMaster Mix12.5 μL,全血模板1μL,上下游引物各0.2 μL,ddH2O 11.1 μL;反应程序为:98℃变性10 s, 退火30 s,68 ℃延伸30 s,扩增 34 个循环,PCR 结束后4 ℃保存。
10.权利要求8过9所述的方法在湖羊分子标记育种中的应用。
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