[发明专利]g.55904G＞A、g.55993T＞C和g.56067G＞A在湖羊分子标记辅助育种中的应用

说明书

本发明属于湖羊分子标记辅助育种技术领域，具体涉及SNPs分子标记g.55904G＞A、g.55993T＞C和g.56067G＞A在湖羊分子标记辅助育种中的应用。该分子标记定位为g.55904G＞A、g.55993T＞C和/或g.56067G＞A；其中：g.55904G＞A与胸围，初生重显著相关，AA个体的胸围显著高于GA，GG个体，GG个体的初生重显著高于AA与GA个体；g.55993T＞C与胸围显著相关，CC基因型显著高于TT个体，与TC相比差异不显著，TT与TC相比差异不显著；g.56067G＞A与胸围，初生重显著相关，AA基因型的胸围显著高于GA与GG个体，GG与GA相比差异不显著，GG个体的初生重显著高于GA，AA个体，GA与AA相比差异不显著。

技术领域

本发明属于湖羊分子标记辅助育种技术领域，具体涉及SNPs分子标记g.55904G＞A、g.55993T＞C和g.56067G＞A在湖羊分子标记辅助育种中的应用。

背景技术

湖羊是我国珍稀的绵羊品种，原产于太湖流，所产羔皮花纹美观而著称，是我国特有的羔皮用绵羊品种，也是目前世界上少有的白色羔皮品种，在国际市场上享有很高的声誉，有“软宝石”之称。湖羊肉质鲜美湖羊体型大产肉量高，且肉质鲜美，营养丰富。湖羊肉与其他肉类相比,具有高蛋白、低脂肪、低胆固醇的优点,多汁、膻味小。但湖羊产在肉性能方面与杜泊羊、德国美利奴羊等国外肉用绵羊品种还存在较大差异。因此，非常有必要对湖羊生长性能进行选育，提高湖羊的产肉性能。

本申请人已有授权中国发明专利(公开号：CN109251986A、CN109182553A、CN109251987A、CN109251985A、CN109182554A和CN109055579A)公开了利用GWAS技术筛选的湖羊体尺性状候选功能基因及SNPs，并通过SNPs的群体验证，获得了可用于分子标记辅助育种的SNPs，可用于湖羊肉用性状分子标记辅助育种和湖羊肉用系核心群个体的早期选育。

前期，本申请人还申请了中国发明专利申请(CN114381531A、CN114438232A、CN114574596A、CN114480676A)公开了在ARHGAP24基因内含子1部分区内有15个SNPs,其中与湖羊体重、体尺性状显著相关的SNPs位点有4个：1.g.43756G＞A与湖羊体长显著相关，AA型个体的体长显著高于GA型个体(P＜0.05)，GG型个体与GA，AA型个体相比差异不显著(P＞0.05)。2.g.43815G＞A与湖羊体高显著相关，AA型个体的体高显著高于GG型个体(P＜0.05)，GA型个体与GG，AA型个体相比差异不显著(P＞0.05)。3.g.43851G＞A与湖羊体长显著相关，AA型个体的体长显著高于GA型个体(P＜0.05)，GG型个体与GA，AA型个体相比差异不显著(P＞0.05)。4.g.43917A＞G与湖羊体长和日增重显著相关，AA与GG型个体的体长显著高于AG型个体(P＜0.05)，AA与GG相比差异不显著(P＞0.05)，GG型个体断奶到六月龄日增重显著高于AA型个体，AG型个体与AA，GG相比差异不显著。

钙蛋白酶(Calpain,CAPN)，是一类存在于脊椎动物细胞质中的钙依赖性半胱氨酸中性蛋白水解酶，与钙蛋白酶抑制蛋白(Calpastatin,CAST)和钙蛋白酶激活蛋白(CalpainActivator)构成依赖于钙离子的蛋白水解酶系统，对动物宰后肌肉成熟嫩化过程有重要作用。CAPN3(Calpain3)也称为p94，是钙蛋白酶基因家族的成员之一，骨骼肌中特异性表达的钙蛋白酶。CAPN3的结构与CAPN1和CAPN2的大亚基相似，有四个结构域；I、II、III和IV，三个CAPN3的特殊序列，分别是NS、IS1和IS2，位于N端、DII蛋白酶结构域和DIII与DIV Ca2-D之间、DIII和DIV位于Ca2t结合域之间。在人体中CAPN3基因缺陷可引起人的2A型肢带型肌营养不良。