[发明专利]与小麦抗条锈病基因QYr.sicau.-2BL连锁的SNP分子标记及应用

说明书

本发明公开了与小麦抗条锈病基因QYr.sicau.‑2BL连锁的SNP分子标记及应用，属于分子育种技术领域。所述SNP分子标记利用如SEQ ID NO.1～3所示特异性引物组扩增得到；所述SNP分子标记与小麦抗条锈病QTL QYr.sicau.‑2BL共定位于小麦2B染色体长臂上，多态性为T/C。该分子标记能准确跟踪所述小麦抗条锈病基因QYr.sicau‑2BL，预测小麦的抗条锈病特性，进而方便进行分子设计育种。本发明还提供鉴定小麦抗条锈病的方法，能够加强抗条锈病预测的准确性，便于快速筛选出抗条锈病的小麦品种或品系，大大加快小麦高产量品种的选育进程。

技术领域

本发明涉及分子育种技术领域，特别是涉及与小麦抗条锈病基因QYr.sicau.-2BL连锁的SNP分子标记及应用。

背景技术

小麦是世界主要粮食作物，其安全生产对保障全球粮食安全具有重要意义。由条形柄锈菌小麦专化型(Puccinia striiformis Westend.f.sp.tritici Erikss.,Pst)引起的小麦条锈病是世界性重要病害。条锈病具有发生频率高、流行范围广、危害程度大等特点。条锈菌为活体寄生菌，主要侵染小麦叶片，亦也可侵染茎秆、穗部、叶鞘和颖壳等部位，从小麦细胞吸收营养，破坏叶组织，降低光合作用，最终造成小麦减产甚至绝收。发掘抗病基因，培育抗条锈病品种是防治条锈病危害的最有效措施。

目前，从小麦及其近缘物种中报道了84个(Yr1-Yr84)正式命名和大批暂命名的抗条锈病基因。由于条锈菌致病性变异频繁，新毒性生理小种的流行，导致生产上单一抗源为主的品种，在大面积推广3-5年后便“丧失”对条锈病的抗性。小麦中报道的抗条锈病基因，大多数已丧失了对新毒性小种的抗性。因此，亟需发掘新型条锈病抗源以及开发育种选择分子标记。

近年来，基于生物个体间基因组序列单碱基多态性(Single nucleotidepolymorphism，SNP)标记被成功开发。SNP标记位点广泛存在于基因组中，具有较高的稳定性，可以实现高通量检测。以SNP为基础的第三代KASP(Kompetitive allele specificPCR)分子标记基于引物末端碱基的特异匹配，对SNP分型以及检测InDels，可以快速、经济、高效、灵活地实现SNP分子标记检测，在基因定位及分子标记辅助选择育种等方面发挥了重要作用。基于此，开发与抗条锈病位点紧密连锁的高通量KASP分子标记，对于实现抗条锈病位点的快速检测、自动化分子育种，加快抗条锈病小麦新品种的培育具有重要的价值和意义。

发明内容

本发明的目的是提供与小麦抗条锈病基因QYr.sicau.-2BL连锁的SNP分子标记及应用，以解决上述现有技术存在的问题，该SNP分子标记与抗条锈病基因QYr.sicau.-2BL紧密连锁，能够准确鉴别出抗小麦条锈病植株，对于小麦种质资源改良、小麦抗条锈病材料创制或小麦分子辅助育种具有重要意义。

为实现上述目的，本发明提供了如下方案：

本发明提供与小麦抗条锈病基因QYr.sicau.-2BL连锁的SNP分子标记，所述SNP分子标记利用如SEQ ID NO.1～3所示特异性引物组扩增得到。

优选的是，如SEQ ID NO：1-2所示的上游引物5’端分别修饰不同的荧光基团。

优选的是，所述SNP分子标记与小麦抗条锈病QTL QYr.sicau.-2BL共定位于小麦2B染色体长臂上，多态性为T/C。

本发明还提供用于检测所述的SNP分子标记的特异性引物组，所述特异性引物组的核苷酸序列如SEQ ID NO.1～3所示。

本发明还提供用于检测所述的SNP分子标记的试剂盒，包含所述的特异性引物组。

本发明还提供一种鉴定小麦抗条锈病的方法，包括：

1)提取待测植株的基因组DNA；