[发明专利]用于鉴定睡莲品种或检测睡莲种质资源遗传多样性的SRAP分子标记引物组及其应用在审
申请号: | 202310071064.X | 申请日: | 2023-02-01 |
公开(公告)号: | CN116287380A | 公开(公告)日: | 2023-06-23 |
发明(设计)人: | 龙凌云;毛立彦;檀小辉;黄秋伟;李慧敏;丁丽琼;唐毓玮;於艳萍;黄歆怡;覃茜;陆祖正;谢振兴;宾振钧;欧克纬;黄显雅;郝小玲 | 申请(专利权)人: | 广西壮族自治区亚热带作物研究所(广西亚热带农产品加工研究所) |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 北京高沃律师事务所 11569 | 代理人: | 薛红凡 |
地址: | 530001 广*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 鉴定 睡莲 品种 检测 种质 资源 遗传 多样性 srap 分子 标记 引物 及其 应用 | ||
1.用于鉴定睡莲品种和/或检测睡莲种质资源遗传多样性的SRAP分子标记引物组,其特征在于,所述引物组包括以下组合:Em1-Me12、Em2-Me12、Em2-Me15、Em8-Me12、Em8-Me13、Em8-Me14、Em8-Me10、Em9-Me12、Em9-Me15和Em10-Me14;
所述Em1的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示;所述Em2的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示:所述Em8的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示;所述Em9的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示;所述Em10的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示;所述Me10的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示;所述Me12的核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示;所述Me13的核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示;所述Me14的核苷酸序列如SEQ ID NO.9所示;所述Me15的核苷酸序列如SEQ ID NO.10所示。
2.一种用于鉴定睡莲品种和/或检测睡莲种质资源遗传多样性的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求1所述SRAP分子标记引物组。
3.根据权利要求2所述试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括PCRMix和去离子水。
4.权利要求1所述SRAP分子标记引物组或权利要求2或3所述试剂盒在鉴定睡莲品种和/或检测睡莲种质资源遗传多样性中的应用。
5.一种检测睡莲种质资源遗传多样性的方法,其特征在于,包括以下步骤:
以待测样品的DNA为模板DNA,以权利要求1所述SRAP分子标记引物组对所述模板DNA进行PCR扩增,将扩增产物进行电泳,PCR扩增产物在相同迁移率位置上有DNA条带记为1,无DNA条带记为0,形成SRAP的0/1数据矩阵,利用所述0/1数据矩阵,在NTSYS软件中计算样品间的遗传距离,并由NTSYS软件对所得计算样品间的遗传距离进行聚类分析。
6.根据权利要求5所述方法,其特征在于,所述PCR扩增的反应程序包括:94℃预变性2min;第一次PCR:94℃变性40s,36℃复性40s,72℃延伸80s,5个循环;第二次PCR:94℃变性40s,56℃退火40s,72℃延伸80s,36个循环,72℃延伸10min。
7.根据权利要求6所述方法,其特征在于,所述PCR扩增的反应体系以20μL计,包括模板DNA 2μL、所述SRAP分子标记引物组中每个组合的引物各0.5μL、PCR Mix 10μL和ddH2O 7μL。
8.根据权利要求7所述方法,其特征在于,所述引物的浓度均为20μmol/L;所述模板DNA的浓度为50ng/μL。
9.根据权利要求5所述方法,其特征在于,所述待测样品包括睡莲的叶片。
10.根据权利要求9所述方法,其特征在于,所述睡莲的品种包括红宝石、赤子心、蓝宝石、N.Aleci、天之蓝、卵叶睡莲、丹泉石、桑给巴尔之星、狐火、岩山千瓣、天堂、紫云、苏皖那、金色光环、艾伯特、银河系、奇拉格、黄上蓝、莫达拉湾、蓝蟹爪、伊斯兰达、烟绿、斑叶蓝蟹爪、伊丽莎、蓝女士、黄蟹爪、米努它、烟火、公牛眼、雪崩、哈芬根、酸橙、暹罗玉、甘颂文、血色火焰、粉钻、粉色好望角、多丽丝、科罗拉多、斑叶红蟹爪、红色重瓣蟹爪、芭芭拉、蓝色好望角、新苏、热带风情、奥斯塔、迈阿密玫瑰、杰伦萨普、仲克尼、小花、锦黄、粉色烈鸟、蓝紫苑、蓝染、林西伍德、泰王、黄金国、纯真、玛丽安、黑美人、拉萨米、紫乔伊、卡奔、白巨、红IM、紫IM、凯斯隆、Tuonta、白IM、流苏、万维莎、绝色佳人、白千瓣、马哈巴颂、黄西瓜、山莓、艳阳、暹罗幸运、佛琴娜丽丝、小白子午莲、雪白睡莲、夹克粉、白睡莲、霍兰迪亚、诗丽吉皇后、暹罗粉1、暹罗紫1、英国红、红色闪耀、印度红、泰国粉、喀麦隆、埃及白、安塔利亚、小雪夜、秘鲁睡莲、变色澳洲、白蓝星、越南原生、印度延药、优雅睡莲、埃及蓝、美洲白睡莲、美洲白睡莲红叶、蓝星睡莲、海南延药、非洲延药、花胎生、粉巨、科曼契、墨西哥黄和黄乔伊中的至少两种。
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