[发明专利]用于鉴定睡莲品种或检测睡莲种质资源遗传多样性的SRAP分子标记引物组及其应用

说明书

本发明涉及分子鉴定领域，特别是涉及用于鉴定睡莲品种或检测睡莲种质资源遗传多样性的SRAP分子标记引物组及其应用。本发明提供了用于鉴定睡莲品种和/或检测睡莲种质资源遗传多样性的SRAP分子标记引物组，所述引物组包括以下组合：Em1‑Me12、Em2‑Me12、Em2‑Me15、Em8‑Me12、Em8‑Me13、Em8‑Me14、Em8‑Me10、Em9‑Me12、Em9‑Me15和Em10‑Me14。利用本发明所述SRAP分子标记引物组能够准确鉴定睡莲品种和筛选不同品种睡莲的种质，能够减少育种工作量。

技术领域

本发明涉及分子鉴定领域，特别是涉及用于鉴定睡莲品种或检测睡莲种质资源遗传多样性的SRAP分子标记引物组及其应用。

背景技术

睡莲是睡莲科(Nymphaeaceae)睡莲属(Nymphaea)多年生水生草本植物，花期可达7个月，因其花叶色泽丰富，花资优雅清丽，开花量大，且具花叶俱赏的特点而名闻于世，有“水中女神”之美誉，常用于城市水域景观绿化、家庭观赏或制作成鲜切花、干花等加工产品，花卉市场需求量大。

近年来，随着国际花卉市场的开放和流通，众多睡莲品种被引入国内，因此急需对其遗传多样性进行分析，有助于不同品种以及种质鉴定。同时在睡莲新品种选育过程中，优良品系的筛选面临着巨大的工作量，因此，有必要建立有效的遗传多样性分析体系，进而减少育种工作量。

发明内容

为了解决上述问题，本发明提供了用于鉴定睡莲品种或检测睡莲种质资源遗传多样性的SRAP分子标记引物组及其应用。利用本发明所述SRAP分子标记引物组能够准确筛选不同品种睡莲的种质和鉴定睡莲品种，能够减少育种工作量。

为了实现上述目的，本发明提供如下技术方案：

本发明提供了用于鉴定睡莲品种和/或检测睡莲种质资源遗传多样性的SRAP分子标记引物组，所述引物组包括以下组合：Em1-Me12、Em2-Me12、Em2-Me15、Em8-Me12、Em8-Me13、Em8-Me14、Em8-Me10、Em9-Me12、Em9-Me15和Em10-Me14；

所述Em1的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示；所述Em2的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示；所述Em8的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示；所述Em9的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示；所述Em10的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示：所述Me10的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示；所述Me12的核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示；所述Me13的核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示；所述Me14的核苷酸序列如SEQ ID NO.9所示；所述Me15的核苷酸序列如SEQ ID NO.10所示。

本发明提供了一种用于鉴定睡莲品种和/或检测睡莲种质资源遗传多样性的试剂盒，所述试剂盒包括上述SRAP分子标记引物组。

优选的，所述试剂盒还包括PCR Mix和去离子水。

本发明提供了上述SRAP分子标记引物组或上述试剂盒在鉴定睡莲品种和/或检测睡莲种质资源遗传多样性中的应用。

本发明提供了一种鉴定睡莲品种和/或检测睡莲种质资源遗传多样性的方法，包括以下步骤：

以待测样品的DNA为模板DNA，以与上述SRAP分子标记引物组对所述模板DNA进行PCR扩增后进行电泳，PCR扩增产物在相同迁移率位置上有DNA条带记为1，无DNA条带记为0，形成SRAP的0/1数据矩阵，利用所述0/1数据矩阵，在NTSYS软件中计算样品间的遗传距离，并由NTSYS软件对所得计算样品间的遗传距离进行聚类分析。

优选的，所述PCR扩增的反应程序包括：94℃预变性2min；第一次PCR：94℃变性40s，36℃复性40s，72℃延伸80s，5个循环；第二次PCR：94℃变性40s，56℃退火40s，72℃延伸80s，36个循环，72℃延伸10min。