[发明专利]一种检测γδT细胞受体多样性的方法在审
申请号: | 202310138307.7 | 申请日: | 2023-02-09 |
公开(公告)号: | CN116287164A | 公开(公告)日: | 2023-06-23 |
发明(设计)人: | 刘俊;桂智;张敏;赖炳森;李英 | 申请(专利权)人: | 深圳市沃英达生命科学有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869;C12Q1/6806;C12Q1/6888;C12N15/11;C40B50/06 |
代理公司: | 北京睿派知识产权代理有限公司 11597 | 代理人: | 刘锋 |
地址: | 518126 广东省深圳市宝安区西乡*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 细胞 受体 多样性 方法 | ||
1.一种检测γδT细胞受体多样性的方法,其特征在于,所述的方法包括针对TRG的CDR3区域通过单端锚定PCR和巢式PCR构建测序文库进行测序,其中,所述的巢氏PCR中的第一轮PCR为单端锚定PCR。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的巢式PCR中第二轮PCR的上游的扩增子引物包括P5接头序列、P5测序引物序列、随机碱基序列一和靶基因上游特异性引物序列;优选的,所述的随机碱基序列一长度为1-10bp。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的巢式PCR中第二轮PCR的下游的扩增子引物包括P7接头序列、P7标签序列、P7测序引物序列、随机碱基序列二和靶基因下游特异性引物序列,优选的,所述的随机碱基序列二长度为1-10bp,所述的P7标签序列长度为5-10bp。
4.根据权利要求1-3任一所述的方法,其特征在于,所述的P5接头序列如SEQ IDNO:2所示,所述的P5测序引物序列如SEQ ID NO:3所示,所述的靶基因上游特异性引物序列如SEQID NO:4所示,所述的P7接头序列如SEQ ID NO:6所示,所述的P7测序引物序列如SEQ IDNO:7所示,所述的靶基因下游特异性引物序列如SEQ ID NO:8所示。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述的上游的扩增子引物序列如SEQ IDNO:5所示;所述的下游的扩增子引物序列如SEQ ID NO:9所示;所述的单端锚定PCR引物如SEQ ID NO:1所示。
6.一种γδT细胞受体多样性检测试剂盒,其特征在于,所述的试剂盒包含第一轮单端锚定PCR引物和第二轮PCR扩增子引物对,
优选的,所述的第二轮PCR的上游的扩增子引物包括P5接头序列、P5测序引物序列、随机碱基序列一和靶基因上游特异性引物序列;
所述的第二轮PCR的下游的扩增子引物包括P7接头序列、P7标签序列、P7测序引物序列、随机碱基序列二和靶基因下游特异性引物序列,
进一步优选的,所述的随机碱基序列一长度为1-10bp,所述的随机碱基序列二长度为1-10bp,所述的P7标签序列长度为5-10bp。
7.根据权利要求6所述的试剂盒,其特征在于,所述的上游的扩增子引物序列如SEQ IDNO:5所示;所述的下游的扩增子引物序列如SEQ ID NO:9所示;所述的单端锚定PCR引物如SEQ ID NO:1所示。
8.一种γδT细胞受体多样性检测的引物组合,其特征在于,所述的引物组合包括第一轮单端锚定PCR引物、第二轮PCR扩增子引物对,
优选的,所述的第二轮PCR上游的扩增子引物包括P5接头序列、P5测序引物序列、随机碱基序列一和靶基因上游特异性引物序列;所述的第二轮PCR的下游的扩增子引物包括P7接头序列、P7标签序列、P7测序引物序列、随机碱基序列二和靶基因下游特异性引物序列,
进一步优选的,所述的随机碱基序列一长度为1-10bp,所述的随机碱基序列二长度为1-10bp,所述的P7标签序列长度为5-10bp。
9.根据权利要求8所述的引物组合,其特征在于,所述的上游的扩增子引物序列如SEQID NO:5所示;所述的下游的扩增子引物序列如SEQ ID NO:9所示;所述的单端锚定PCR引物如SEQ ID NO:1所示。
10.提供一种权利要求1-5任一所述的方法、权利要求6-7任一所述的试剂盒或权利要求8-9任一所述的引物组合在评估免疫识别能力或制备治疗肿瘤、自身免疫疾病或感染性疾病药物中的应用。
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