[发明专利]一种检测γδT细胞受体多样性的方法在审

专利信息
申请号: 202310138307.7 申请日: 2023-02-09
公开(公告)号: CN116287164A 公开(公告)日: 2023-06-23
发明(设计)人: 刘俊;桂智;张敏;赖炳森;李英 申请(专利权)人: 深圳市沃英达生命科学有限公司
主分类号: C12Q1/6869 分类号: C12Q1/6869;C12Q1/6806;C12Q1/6888;C12N15/11;C40B50/06
代理公司: 北京睿派知识产权代理有限公司 11597 代理人: 刘锋
地址: 518126 广东省深圳市宝安区西乡*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 检测 细胞 受体 多样性 方法
【权利要求书】:

1.一种检测γδT细胞受体多样性的方法,其特征在于,所述的方法包括针对TRG的CDR3区域通过单端锚定PCR和巢式PCR构建测序文库进行测序,其中,所述的巢氏PCR中的第一轮PCR为单端锚定PCR。

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的巢式PCR中第二轮PCR的上游的扩增子引物包括P5接头序列、P5测序引物序列、随机碱基序列一和靶基因上游特异性引物序列;优选的,所述的随机碱基序列一长度为1-10bp。

3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的巢式PCR中第二轮PCR的下游的扩增子引物包括P7接头序列、P7标签序列、P7测序引物序列、随机碱基序列二和靶基因下游特异性引物序列,优选的,所述的随机碱基序列二长度为1-10bp,所述的P7标签序列长度为5-10bp。

4.根据权利要求1-3任一所述的方法,其特征在于,所述的P5接头序列如SEQ IDNO:2所示,所述的P5测序引物序列如SEQ ID NO:3所示,所述的靶基因上游特异性引物序列如SEQID NO:4所示,所述的P7接头序列如SEQ ID NO:6所示,所述的P7测序引物序列如SEQ IDNO:7所示,所述的靶基因下游特异性引物序列如SEQ ID NO:8所示。

5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述的上游的扩增子引物序列如SEQ IDNO:5所示;所述的下游的扩增子引物序列如SEQ ID NO:9所示;所述的单端锚定PCR引物如SEQ ID NO:1所示。

6.一种γδT细胞受体多样性检测试剂盒,其特征在于,所述的试剂盒包含第一轮单端锚定PCR引物和第二轮PCR扩增子引物对,

优选的,所述的第二轮PCR的上游的扩增子引物包括P5接头序列、P5测序引物序列、随机碱基序列一和靶基因上游特异性引物序列;

所述的第二轮PCR的下游的扩增子引物包括P7接头序列、P7标签序列、P7测序引物序列、随机碱基序列二和靶基因下游特异性引物序列,

进一步优选的,所述的随机碱基序列一长度为1-10bp,所述的随机碱基序列二长度为1-10bp,所述的P7标签序列长度为5-10bp。

7.根据权利要求6所述的试剂盒,其特征在于,所述的上游的扩增子引物序列如SEQ IDNO:5所示;所述的下游的扩增子引物序列如SEQ ID NO:9所示;所述的单端锚定PCR引物如SEQ ID NO:1所示。

8.一种γδT细胞受体多样性检测的引物组合,其特征在于,所述的引物组合包括第一轮单端锚定PCR引物、第二轮PCR扩增子引物对,

优选的,所述的第二轮PCR上游的扩增子引物包括P5接头序列、P5测序引物序列、随机碱基序列一和靶基因上游特异性引物序列;所述的第二轮PCR的下游的扩增子引物包括P7接头序列、P7标签序列、P7测序引物序列、随机碱基序列二和靶基因下游特异性引物序列,

进一步优选的,所述的随机碱基序列一长度为1-10bp,所述的随机碱基序列二长度为1-10bp,所述的P7标签序列长度为5-10bp。

9.根据权利要求8所述的引物组合,其特征在于,所述的上游的扩增子引物序列如SEQID NO:5所示;所述的下游的扩增子引物序列如SEQ ID NO:9所示;所述的单端锚定PCR引物如SEQ ID NO:1所示。

10.提供一种权利要求1-5任一所述的方法、权利要求6-7任一所述的试剂盒或权利要求8-9任一所述的引物组合在评估免疫识别能力或制备治疗肿瘤、自身免疫疾病或感染性疾病药物中的应用。

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