[发明专利]用于鼠疫耶尔森菌的CRISPR-Cas12a检测引物组及其应用在审
申请号: | 202310163356.6 | 申请日: | 2023-02-24 |
公开(公告)号: | CN116411100A | 公开(公告)日: | 2023-07-11 |
发明(设计)人: | 齐永;李越希;吕瑞辰;宋亚军;毛颖清;王俊虎;陆年宏;曹勇平;陈琼;陈乐如;周东明;王骁霄 | 申请(专利权)人: | 中国人民解放军东部战区疾病预防控制中心 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6844;C12N15/113;C12N15/11;C12R1/01 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 白艳 |
地址: | 210002 江苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 鼠疫 耶尔森菌 crispr cas12a 检测 引物 及其 应用 | ||
1.一种用于检测鼠疫耶尔森菌的CRISPR-Cas12a系统,包括Cas12a蛋白和crRNA,或二者形成的复合体;
所述crRNA包括用于与Cas12a蛋白结合的锚定序列和靶向鼠疫耶尔森菌靶点序列的向导序列;
所述鼠疫耶尔森菌的靶点序列来自鼠疫耶尔森菌的SEQ ID No.1所示的CH57_3927基因上。
2.根据权利要求1所述的CRISPR-Cas12a系统,其特征在于:
所述鼠疫耶尔森菌的靶点序列为SEQ ID No.15第22-44位所示RNA片段的编码DNA。
3.根据权利要求1或2所述的CRISPR-Cas12a系统,其特征在于:
所述crRNA的序列为SEQ ID No.15;
或,所述Cas12a蛋白为LbCas12a蛋白。
4.一种用于检测鼠疫耶尔森菌的试剂盒,其包括如下:
1)权利要求1-3任一所述的用于检测鼠疫耶尔森菌的CRISPR-Cas12a系统;
2)用于特异性扩增权利要求1-3任一中的所述鼠疫耶尔森菌靶点序列的RAA扩增引物;
3)作为荧光报告分子的探针;
所述探针的两端分别标记荧光基团和淬灭基团。
5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于:
所述RAA扩增引物由SEQ ID No.2所示的单链DNA分子和SEQ ID No.9所示的单链DNA分子组成;
所述探针的核苷酸序列为SEQ ID No.28。
6.如下任一物质:
A1)权利要求1-3任一中所述的crRNA;
A2)权利要求1-3任一中所述的Cas12a蛋白和crRNA,或者二者形成的复合体;
A3)权利要求4或5中所述的RAA扩增引物;
A4)权利要求4或5中所述的探针。
7.如下任一应用:
B1)权利要求1-3任一所述的系统或权利要求4或5所述的试剂盒或权利要求6所述的物质在检测或辅助检测鼠疫耶尔森菌或其核酸中的应用;
B2)权利要求1-3任一所述的系统或权利要求4或5所述的试剂盒或权利要求6所述的物质在制备检测或辅助检测鼠疫耶尔森菌或其核酸的产品中的应用;
B3)权利要求1-3任一所述的系统或权利要求4或5所述的试剂盒或权利要求6所述的物质在检测或辅助检测待测样本中是否含有鼠疫耶尔森菌或其核酸中的应用;
B4)权利要求1-3任一所述的系统或权利要求4或5所述的试剂盒或权利要求6所述的物质在制备检测或辅助检测待测样本中是否含有鼠疫耶尔森菌或其核酸的产品中的应用;
B5)权利要求1-3任一所述的系统或权利要求4或5所述的试剂盒或权利要求6所述的物质在诊断或辅助诊断待测样本中是否感染鼠疫耶尔森菌中的应用;
B6)权利要求1-3任一所述的系统或权利要求4或5所述的试剂盒或权利要求6所述的物质在制备诊断或辅助诊断待测样本中是否感染鼠疫耶尔森菌的产品中的应用;
B7)权利要求1-3任一所述的系统或权利要求4或5所述的试剂盒或权利要求6所述的物质在筛选或辅助筛选鼠疫耶尔森菌防治药物中的应用;
B8)权利要求1-3任一所述的系统或权利要求4或5所述的试剂盒或权利要求6所述的物质在制备筛选或辅助筛选鼠疫耶尔森菌防治药物的产品中的应用;
B9)权利要求6所述的物质在制备权利要求4或5所述试剂盒中的应用;
B10)SEQ ID No.1所示的DNA分子作为检测鼠疫耶尔森菌的靶基因在检测或辅助检测鼠疫耶尔森菌或其核酸中的应用;
B11)SEQ ID No.1所示的DNA分子作为检测鼠疫耶尔森菌的靶基因在制备检测或辅助检测鼠疫耶尔森菌或其核酸的超中的应用。
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