[发明专利]SNP标记在小鼠亚系鉴定中的应用及引物序列在审
申请号: | 202310216604.9 | 申请日: | 2023-03-08 |
公开(公告)号: | CN116334241A | 公开(公告)日: | 2023-06-27 |
发明(设计)人: | 魏杰;左琴;赵蓝;朱婉月;周佳琪;刘巍;李欢;王洪;贾松华;光姣娜;马丽颖;付瑞;梁春南;岳秉飞 | 申请(专利权)人: | 中国食品药品检定研究院 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12Q1/6804;C12N15/11 |
代理公司: | 北京尚诚知识产权代理有限公司 11322 | 代理人: | 叶占洋;鲁兵 |
地址: | 102629 北京*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | snp 标记 小鼠 鉴定 中的 应用 引物 序列 | ||
1.一种SNP标记在小鼠亚系鉴定中的应用,其特征在于,利用至少包括3个SNP位点的SNP标记组合对3个C57BL/6小鼠亚系或2个BALB/c小鼠亚系进行鉴定,其中所述3个C57BL/6小鼠亚系选自C57BL/6N、C57BL/6J和C57BL/6-bg,所述2个BALB/c小鼠亚系选自BALB/cJ和BALB/cCrSlc;所述SNP标记组合至少包括选自以下1)-18)中任一组的3个SNP位点:
1)命名为SNP1、SNP8和SNP3的3个SNP位点;
2)命名为SNP1、SNP8和SNP2的3个SNP位点;
3)命名为SNP1、SNP8和SNP4的3个SNP位点;
4)命名为SNP1、SNP6和SNP3的3个SNP位点;
5)命名为SNP1、SNP6和SNP2的3个SNP位点;
6)命名为SNP1、SNP6和SNP4的3个SNP位点;
7)命名为SNP1、SNP7和SNP3的3个SNP位点;
8)命名为SNP1、SNP7和SNP2的3个SNP位点;
9)命名为SNP1、SNP7和SNP4的3个SNP位点;
10)命名为SNP6、SNP2和SNP5的3个SNP位点;
11)命名为SNP6、SNP3和SNP5的3个SNP位点;
12)命名为SNP6、SNP4和SNP5的3个SNP位点;
13)命名为SNP7、SNP2和SNP5的3个SNP位点;
14)命名为SNP7、SNP3和SNP5的3个SNP位点;
15)命名为SNP7、SNP4和SNP5的3个SNP位点;
16)命名为SNP8、SNP2和SNP5的3个SNP位点;
17)命名为SNP8、SNP3和SNP5的3个SNP位点;
18)命名为SNP8、SNP4和SNP5的3个SNP位点;
其中:
所述SNP1的Ensembl rs编号为rs3709624,其等位基因为T或C;
所述SNP2的Ensembl rs编号为rs3659787,其等位基因为T或C;
所述SNP3的Ensembl rs编号为rs3722313,其等位基因为T或C;
所述SNP4的Ensembl rs编号为rs3702158,其等位基因为A或G;
所述SNP5的Ensembl rs编号为rs3724876,其等位基因为G或T;
所述SNP6的Ensembl rs编号为rs3712692,其等位基因为G或T;
所述SNP7的Ensembl rs编号为rs3706082,其等位基因为T或C;
所述SNP8的Ensembl rs编号为rs3656801,其等位基因为G或A。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述SNP标记组合为包括SNP1-SNP8这8个SNP位点的组合。
3.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述SNP标记组合为还包括选自命名为SNP9、SNP10、SNP14和SNP16中的一个或多个位点的至少包括4个SNP位点的组合,所述应用为利用该组合同时对5个小鼠亚系进行鉴定,其中所述5个小鼠亚系选自C57BL/6N、C57BL/6J、C57BL/6-bg、BALB/cJ和BALB/cCrSlc;其中:
所述SNP9的Ensembl rs编号为rs3023251,其等位基因为T或C;
所述SNP10的Ensembl rs编号为rs3088673,其等位基因为T或G;
所述SNP14的Ensembl rs编号为rs3023177,其等位基因为C或A;
所述SNP16的Ensembl rs编号为rs3089984,其等位基因为A或C。
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