[发明专利]SNP标记在小鼠亚系鉴定中的应用及引物序列

说明书

本发明公开了一种SNP标记在小鼠亚系鉴定中的应用及引物序列。本发明提供的SNP标记为包括至少3个SNP位点的组合，能够对包括C57BL/6N、C57BL/6J和C57BL/6‑bg在内的3个C57BL/6小鼠亚系，和/或包括BALB/cJ和BALB/cCrSlc在内的2个BALB/c小鼠亚系进行鉴定，提高了小鼠亚系鉴定的范围，还可节约鉴定成本。

技术领域

本发明属于小鼠品系鉴定的技术领域，具体涉及一种SNP标记在小鼠亚系鉴定中的应用及引物序列。

背景技术

实验动物是指经人工饲育且对其携带的微生物实行控制、遗传背景明确或者来源清楚、用于科学研究、教学、生产、检定以及其他科学实验的动物。常见的实验动物有实验大鼠和实验小鼠，包括有数千种封闭群、近交系、重组同类系、重组近交系和突变系等品系。

在常见的、历史比较久的多种小鼠亚系中，在诸多方面都存在差异，而这些差异在表观遗传学性状上表现不明显，几乎无法单纯从外观上来鉴定小鼠亚系，且这些差异会导致实验数据的偏差。随着生命医学的发展，科研人员和商业对实验动物质量的要求越来越高。因此，对小鼠亚系的鉴定成了亟待解决的问题。

专利文献CN114317767A(以下称文献1)公开一种区别C57BL/6亚系小鼠的引物、试剂盒和方法，其采用3组至少3个SNP位点(例如rs244794780、rs260260338和rs224344563，或rs226310424、rs260260338和rs239219835等)能够区分出C57BL/6N亚系、C57BL/6J亚系及C57BL/6By亚系，同时也可鉴定到C57BL/6N亚系中的C57BL/6NJ、或C57BL/6NCrl与C57BL/6NTac的组合。然而，该文献1公开的SNP位点的组合只能区分C57BL/6亚系小鼠，而无法区分BALB/c亚系小鼠，更是无法同时区分C57BL/6亚系小鼠和BALB/c亚系小鼠，因此该文献1公开的SNP位点的组合的通用性较差。

发明内容

针对现有技术中存在的问题的一个或多个，本发明一个方面提供一种SNP标记在小鼠亚系鉴定中的应用，其利用至少包括3个SNP位点的SNP标记组合对3个C57BL/6小鼠亚系或2个BALB/c小鼠亚系进行鉴定，其中所述3个C57BL/6小鼠亚系选自C57BL/6N、C57BL/6J和C57BL/6-bg，所述2个BALB/c小鼠亚系选自BALB/cJ和BALB/cCrSlc；所述SNP标记组合至少包括选自以下1)-18)中任一组的3个SNP位点：

1)命名为SNP1、SNP8和SNP3的3个SNP位点；

2)命名为SNP1、SNP8和SNP2的3个SNP位点；

3)命名为SNP1、SNP8和SNP4的3个SNP位点；

4)命名为SNP1、SNP6和SNP3的3个SNP位点；

5)命名为SNP1、SNP6和SNP2的3个SNP位点；

6)命名为SNP1、SNP6和SNP4的3个SNP位点；

7)命名为SNP1、SNP7和SNP3的3个SNP位点；

8)命名为SNP1、SNP7和SNP2的3个SNP位点；

9)命名为SNP1、SNP7和SNP4的3个SNP位点；

10)命名为SNP6、SNP2和SNP5的3个SNP位点；

11)命名为SNP6、SNP3和SNP5的3个SNP位点；

12)命名为SNP6、SNP4和SNP5的3个SNP位点；

13)命名为SNP7、SNP2和SNP5的3个SNP位点；