[发明专利]一种用于预测早期慢阻肺的生物标志物及其应用和筛选方法在审
申请号: | 202310225225.6 | 申请日: | 2023-03-06 |
公开(公告)号: | CN116656802A | 公开(公告)日: | 2023-08-29 |
发明(设计)人: | 赵大海;陈亮;刘鹏程;叶静;刘辉;马长秀;沈兵;李仁明 | 申请(专利权)人: | 安徽医科大学第二附属医院 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/6869 |
代理公司: | 上海恩凡知识产权代理有限公司 31459 | 代理人: | 汪贺玲 |
地址: | 230000 安徽省*** | 国省代码: | 安徽;34 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 预测 早期 慢阻肺 生物 标志 及其 应用 筛选 方法 | ||
1.一种用于预测早期慢阻肺的生物标志物,其特征在于,所述生物标志物为环状RNA:circFCHO2。
2.如权利要求1所述的生物标志物在制备用于预测早期慢阻肺风险的产品中的应用。
3.如权利要求1所述的预测早期慢阻肺的生物标志物的筛选方法,其特征在于,包括:
步骤(a)、收集慢阻肺患者和健康对照者的新鲜外周血标本,进行全血RNA提取,对提取的全血RNA进行OD260/280值的检测,数值在1.8-2.0认为RNA纯度达标;
步骤(b)、对全血RNA进行处理构建circRNA文库,并利用高通量测序检测circRNA的表达,筛选出差异表达的环状RNA:P0.05和|log2(fold change)|≥1,挑选circFCHO2作为预测慢阻肺的生物标志物;
步骤(c)、扩大样本对circFCHO2经行qRT-PCR验证。
4.如权利要求3所述的生物标志物的筛选方法,其特征在于,步骤(b)的具体方法如下:
1)COPD和健康受试者的RNA首先经过去除核糖体RNA处理,circRNA建库需要提前使用RNase R酶消化掉线性RNA。将去核糖体的RNA打断成250~300bp的小片段,以该小片段为模板,逆转录为cDNA,最后通过PCR扩增建立文库;
2)将建立好的文库进行Qubit 2.0定量、Agilent 2100片段大小分析、qRT-PCR文库丰度定量等质控检测合格后,利用Illumina novaseq 6000平台进行高通量测序。
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