[发明专利]一种用于富集、扩增尿液eccDNA的试剂盒及方法和用途在审

专利信息
申请号: 202310321650.5 申请日: 2023-03-29
公开(公告)号: CN116103373A 公开(公告)日: 2023-05-12
发明(设计)人: 林春华;王文亭 申请(专利权)人: 林春华;王文亭
主分类号: C12Q1/6806 分类号: C12Q1/6806
代理公司: 北京正元瑞驰知识产权代理事务所(普通合伙) 16090 代理人: 吴琼
地址: 264000 山东*** 国省代码: 山东;37
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摘要:
搜索关键词: 一种 用于 富集 扩增 尿液 eccdna 试剂盒 方法 用途
【权利要求书】:

1.一种用于富集和扩增尿液中eccDNA的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括DNA提取试剂、第一内参质粒、第二内参质粒、DNA纯化试剂、eccDNA富集试剂和eccDNA建库试剂。

2.根据权利要求1所述的用于富集和扩增尿液中eccDNA的试剂盒,其特征在于,所述第一内参质粒和第二内参质粒各自含有酶切识别位点,所述酶切识别位点包括Not I或Mss I酶切识别位点。

3.根据权利要求2所述的用于富集和扩增尿液中eccDNA的试剂盒,其特征在于,所述第一内参质粒和第二内参质粒选自P1035质粒或P895质粒。

4.根据权利要求3所述的用于富集和扩增尿液中eccDNA的试剂盒,其特征在于,所述DNA提取试剂包括低分子醇溶液。

5.根据权利要求3所述的用于富集和扩增尿液中eccDNA的试剂盒,其特征在于,所述DNA纯化试剂包括纯化磁珠。

6.根据权利要求3所述的用于富集和扩增尿液中eccDNA的试剂盒,其特征在于,所述eccDNA富集试剂包括核酸外切酶。

7.根据权利要求3所述的用于富集和扩增尿液中eccDNA的试剂盒,其特征在于,所述eccDNA建库试剂包括Tn5转座酶。

8.根据权利要求1-7任一项所述的用于富集和扩增尿液中eccDNA的试剂盒在以下任一种中的应用:

(1)制备富集和扩增尿液中eccDNA的产品;

(2)制备检测尿液中eccDNA的产品;

(3)制备开发或筛选肿瘤相关标志物的产品;

(4)制备肿瘤进展监测与评估的产品。

9.一种检测尿液中eccDNA的方法,其特征在于,包括使用权利要求1-7任一项所述的试剂盒富集和扩增尿液中eccDNA的步骤。

10.根据权利要求9所述的检测尿液中eccDNA的方法,其特征在于,包括:

1)提取尿液中的DNA样本,并在所述DNA样本中加入第一内参质粒和第二内参质粒,得到含有内参质粒的DNA样本,其中,所述第一内参质粒和所述第二内参质粒含有酶切识别位点;

2)消化含有第一内参质粒和第二内参质粒的DNA样本中的线性DNA,得到环状DNA;

3)纯化所述环状DNA;

4)扩增纯化后环状DNA,富集所述环状DNA,得到RCA扩增产物;

5)纯化所述RCA扩增产物,得到纯化后RCA扩增产物;

6)采用所述酶切识别位点对应的限制性内切酶对所述纯化后RCA扩增产物进行双酶切质控。

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