[发明专利]一种用于富集、扩增尿液eccDNA的试剂盒及方法和用途在审
申请号: | 202310321650.5 | 申请日: | 2023-03-29 |
公开(公告)号: | CN116103373A | 公开(公告)日: | 2023-05-12 |
发明(设计)人: | 林春华;王文亭 | 申请(专利权)人: | 林春华;王文亭 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806 |
代理公司: | 北京正元瑞驰知识产权代理事务所(普通合伙) 16090 | 代理人: | 吴琼 |
地址: | 264000 山东*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 富集 扩增 尿液 eccdna 试剂盒 方法 用途 | ||
1.一种用于富集和扩增尿液中eccDNA的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括DNA提取试剂、第一内参质粒、第二内参质粒、DNA纯化试剂、eccDNA富集试剂和eccDNA建库试剂。
2.根据权利要求1所述的用于富集和扩增尿液中eccDNA的试剂盒,其特征在于,所述第一内参质粒和第二内参质粒各自含有酶切识别位点,所述酶切识别位点包括Not I或Mss I酶切识别位点。
3.根据权利要求2所述的用于富集和扩增尿液中eccDNA的试剂盒,其特征在于,所述第一内参质粒和第二内参质粒选自P1035质粒或P895质粒。
4.根据权利要求3所述的用于富集和扩增尿液中eccDNA的试剂盒,其特征在于,所述DNA提取试剂包括低分子醇溶液。
5.根据权利要求3所述的用于富集和扩增尿液中eccDNA的试剂盒,其特征在于,所述DNA纯化试剂包括纯化磁珠。
6.根据权利要求3所述的用于富集和扩增尿液中eccDNA的试剂盒,其特征在于,所述eccDNA富集试剂包括核酸外切酶。
7.根据权利要求3所述的用于富集和扩增尿液中eccDNA的试剂盒,其特征在于,所述eccDNA建库试剂包括Tn5转座酶。
8.根据权利要求1-7任一项所述的用于富集和扩增尿液中eccDNA的试剂盒在以下任一种中的应用:
(1)制备富集和扩增尿液中eccDNA的产品;
(2)制备检测尿液中eccDNA的产品;
(3)制备开发或筛选肿瘤相关标志物的产品;
(4)制备肿瘤进展监测与评估的产品。
9.一种检测尿液中eccDNA的方法,其特征在于,包括使用权利要求1-7任一项所述的试剂盒富集和扩增尿液中eccDNA的步骤。
10.根据权利要求9所述的检测尿液中eccDNA的方法,其特征在于,包括:
1)提取尿液中的DNA样本,并在所述DNA样本中加入第一内参质粒和第二内参质粒,得到含有内参质粒的DNA样本,其中,所述第一内参质粒和所述第二内参质粒含有酶切识别位点;
2)消化含有第一内参质粒和第二内参质粒的DNA样本中的线性DNA,得到环状DNA;
3)纯化所述环状DNA;
4)扩增纯化后环状DNA,富集所述环状DNA,得到RCA扩增产物;
5)纯化所述RCA扩增产物,得到纯化后RCA扩增产物;
6)采用所述酶切识别位点对应的限制性内切酶对所述纯化后RCA扩增产物进行双酶切质控。
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