[发明专利]一种多囊卵巢综合征合并子宫内膜癌的标记物筛选方法

权利要求书

1.一种多囊卵巢综合征合并子宫内膜癌的标记物筛选方法，其特征在于，包括以下步骤：

S1、基因表达图谱数据收集:

从GEO数据库收集了多囊卵巢综合征、子宫内膜癌和对照样本的两个微阵列表数据集；

S2、差异表达基因的选择:

数据集从GEO下载，标准化，用R包edgeR提取差异表达基因，计算单个基因的差异倍数变化，使用R语言包VennDiagram获得共享的差异表达基因，筛选标准为p0.05，

|log₂FC|1,筛选结果绘制成维恩图以确定多囊卵巢综合征和子宫内膜癌之间重叠的差异表达基因；

S3、差异表达基因的功能富集分析

使用GO和KEGG数据库对上述重叠的基因组进行GO功能富集分析；

S4、建立基因互作网络和鉴定核心基因

使用了STRING搜索工具进行PPI网络构建；

S5、基因调控网络分析

利用NetworkAnalyst分析确定了核心基因-miRNA相互作用网络和转录因子-核心基因相互作用网络；

S6、受试者操作特性曲线(ROC)绘制

使用GraphPadPrism8.0分析了核心基因在训练集中的表达，并利用ROC曲线计算了每个核心基因的曲线下面积以评估其诊断性能；

S7、结果

多囊卵巢综合征和子宫内膜癌中差异表达基因的鉴定，重叠差异表达基因的GO和KEGG分析，PPI网络构建与核心基因的鉴定和核心基因的诊断曲线。

2.根据权利要求1所述的一种多囊卵巢综合征合并子宫内膜癌的标记物筛选方法，其特征在于:S6步骤中ROC曲线分析了7个核心基因。

3.根据权利要求2所述的一种多囊卵巢综合征合并子宫内膜癌的标记物筛选方法，其特征在于:所述的7个核心基因为CCND1、MMP9、CDH1、PKM、RPS6KA1、PPP1CA和TLR2。

根据权利要求2所述的一种多囊卵巢综合征合并子宫内膜癌的标记物筛选方法，其特征在于:S6步骤中GO功能富集分析包括生物过程、细胞成分和分子功能，并进行KEGG信号通路富集分析。