[发明专利]一种多囊卵巢综合征合并子宫内膜癌的标记物筛选方法

说明书

本发明涉及一种多囊卵巢综合征合并子宫内膜癌的标记物筛选方法，采用生物信息学方法筛选子宫内膜癌和多囊卵巢综合征的共同差异表达基因，确定其信号通路，通过构建蛋白质相互作用网络和算法分析确定核心基因。构建转录因子、miRNA与核心基因的互作网络，利用ROC曲线评估核心基因的诊断性能，最终筛选获得7个基因CCND1、MMP9、CDH1、PKM、RPS6KA1、PPP1CA和TLR2。本发明对多囊卵巢综合征与子宫内膜癌的合并症的检测和治疗提供了新思路，能够用于制备降低多囊卵巢综合征伴子宫内膜癌风险的药物。

技术领域

本发明涉及生物检测技术领域，具体是指一种多囊卵巢综合征合并子宫内膜癌的标记物筛选方法。

背景技术

多囊卵巢综合征是最常见的内分泌失调，影响约5-15％的育龄女性，其特征是高雄激素血症、稀发排卵和多囊卵巢。据报道，80％以上的多囊卵巢综合征患者患有高雄激素血症。此外，患有多囊卵巢综合征的女性面临长期并发症的风险，包括肥胖、2型糖尿病、非酒精性脂肪肝和心血管疾病等。

子宫是孕育胎儿和维持女性性别特征的重要器官。子宫内膜癌(UCEC)是起源于子宫腔内膜上皮的恶性肿瘤，是原发子宫的恶性肿瘤，也是女性生殖系统最常见的恶性肿瘤。近年来，子宫内膜癌的发病率越来越高，其发病年龄呈年轻化趋势，是中国第二大妇科恶性肿瘤。

调查研究显示，多囊卵巢综合征伴子宫内膜癌的可能性明显高于正常人群，然而分子机制并不清楚。弄清楚二者的共同分子机制，筛选共同的分子标志物对早期诊断和干预具有重要的临床意义，目前也没有该方面的研究。

发明内容

本发明要解决上述技术问题，提供一种多囊卵巢综合征合并子宫内膜癌的标记物筛选方法。

为解决上述技术问题，本发明提供的技术方案为：

一种多囊卵巢综合征合并子宫内膜癌的标记物筛选方法，包括以下步骤：

S1、基因表达图谱数据收集:

从GEO数据库收集了多囊卵巢综合征、子宫内膜癌和对照样本的两个微阵列表数据集；

S2、差异表达基因的选择:

数据集从GEO下载，标准化，用R包edgeR提取差异表达基因，计算单个基因的差异倍数变化，使用R语言包VennDiagram获得共享的DEG，筛选标准为p0.05，|log₂FC|1,筛选结果绘制成维恩图以确定多囊卵巢综合征和子宫内膜癌之间重叠的差异表达基因；

S3、差异表达基因的功能富集分析

使用GO和KEGG数据库对上述重叠的基因组进行GO功能富集分析；

S4、建立基因互作网络和识别核心基因

使用STRING搜索工具进行PPI网络构建；

S5、基因调控网络分析

利用NetworkAnalyst分析确定了核心基因-miRNA相互作用网络和转录因子-核心基因相互作用网络；

S6、操作特性曲线(ROC)绘制

使用GraphPadPrism8.0分析了核心基因在训练集中的表达，并利用ROC曲线计算了每个核心基因的曲线下面积以评估其诊断性能；

S7、结果

多囊卵巢综合征和子宫内膜癌中差异表达基因的鉴定，重叠差异表达基因的GO和KEGG分析，PPI网络构建与核心基因的鉴定和核心基因的诊断曲线。

优选地，S6步骤中ROC曲线分析了7个核心基因。