[发明专利]用于评估COVID-19患者康复1年后中和抗体水平的粪便真菌微生物基因标志物

权利要求书

1.一种用于评估COVID-19患者康复1年后中和抗体水平的粪便真菌微生物基因标志物，其特征在于：由SEQ ID NO:1-18所示的18种微生物基因组成，所述微生物在粪便中富集。

2.一种用于检测权利要求1所述粪便真菌微生物基因标志物的检测试剂，包括用于检测权利要求1所述的SEQ ID NO:1-18所示的18种微生物基因的引物，所述引物序列为SEQID NO:19-20。

3.权利要求2所述检测试剂在制备COVID-19患者康复1年后中和抗体水平的评估产品中的应用，所述检测试剂适用于检测权利要求1所述的粪便真菌微生物基因。

4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于：所述粪便真菌微生物模型适用于评估COVID-19患者康复1年后中和抗体水平，其中中和抗体抑制率≥70％被认为是高水平，30％≤中和抗体抑制率＜70％被认为是低水平，中和抗体抑制率＜30％被认为是中和抗体阴性。

5.根据权利要求3所述的应用，其特征在于：对所述对象的粪便进行检测，以便确定该样本是否包含所述的微生物基因，是否可以建立评估COVID-19患者康复1年后中和抗体水平的微生物基因模型。

6.根据权利要求5所述的应用，其特征在于：通过收集入组对象的粪便样本，抽提微生物总DNA，完成微生物DNA的ITS测序，检测是否存在权利要求1所述的18种微生物基因。

7.根据权利要求6所述的应用，其特征在于：通过收集入组对象的粪便样本，抽提微生物总DNA，进行口腔菌群的ITS测序；基于高通量测序数据，建立COVID-19患者康复1年后中和抗体水平的微生物评估模型，建立新冠康复者1年后中和抗体的患病率POD指数。

8.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，具体包括：

(1)收集35例新冠肺炎康复患者出院时的粪便，按照DNA的标准抽提方法完成粪便样本中微生物总DNA的抽提，在Illumina MiSeq平台完成粪便真菌的ITS高通量测序工作；出院1年后留取血清标本检测中和抗体水平；

(2)基于高通量测序数据，在微生物评估模型中，在中和抗体高水平者和中和抗体低水平者之间，基于一个随机森林模型，通过一个五倍交叉验证的算法，鉴定了用于该模型的最佳的18个微生物基因标志物；

(3)基于18个微生物基因标志物，通过使用随机生成的决策树的比率来计算新冠康复者1年后中和抗体的患病率POD指数；

(4)该微生物评估模型在5例中和抗体高水平者和6例中和抗体低水平者之间的区别能力达到96.67％，POD指数在中和抗体低水平者中明显升高，两组之间有显著性差异。

9.一种用于评估COVID-19患者康复1年后中和抗体水平的粪便微生物模型的产品，包括用于检测权利要求1所述的SEQ ID NO:1-18所示的18种微生物基因的引物。