[发明专利]用于评估COVID-19患者康复1年后中和抗体水平的粪便真菌微生物基因标志物

说明书

本发明属于生物医药技术领域，具体涉及一种用于COVID‑19患者康复1年后中和抗体无创预测的粪便真菌微生物基因标志物及其应用。本发明提供了一种用于评估COVID‑19患者康复1年后中和抗体水平的粪便真菌微生物基因标志物(微生物基因评估模型)，由SEQ ID NO:1‑18所示的18种微生物基因组成，所述微生物基因在人体粪便中富集。本发明的微生物基因评估模型在COVID‑19患者康复1年后中和抗体水平的评估中实现了良好的评估能力。

技术领域

本发明属于生物医药技术领域，具体涉及一种用于COVID-19患者康复1年后中和抗体无创预测的粪便真菌微生物基因标志物及其应用。

背景技术

2019冠状病毒病(Coronavirus Disease 2019,COVID-19)在全球范围内肆虐。目前，全世界的注意力都集中在如何有效管理肺炎上，但不可否认的是，康复者正在逐渐增加。人们认识到，疾病消退后，大量COVID-19患者出现了身体特有的疾病，包括疲劳、睡眠困难、焦虑、抑郁、腹泻和呼吸困难，这被称为“长COVID-19”.一项随访研究表明，从COVID-19中康复的1733名患者中，有76％至少出现了一种症状，但在6个月内未消退(Lancet，2021).关注康复者不仅旨在改善患者的预后和生活质量，而且还可能为COVID-19的诊断和治疗提供独特的视角。尽管许多症状在医学上被归类为轻微症状，但它们严重影响生活质量。事实上，在从COVID-19中恢复的受试者中可以观察到长期微生物群失调和细胞因子改变，这意味着COVID-19后的微生物群与免疫状态和身体健康状况的改变密切相关，并且可能是症状的潜在原因。

人类微生态是一个复杂而动态的生态系统，在营养代谢、免疫发育和调节方面发挥着至关重要的功能，与HIV、HBV和H7N9等病毒性疾病的发生和发展密切相关。肠道含有约10¹⁴种常驻细菌，古细菌，病毒和真菌，可调节新陈代谢和整体健康。此外，它是人类最大的淋巴器官，是记忆T细胞的主要来源，在抵抗病原体感染方面起着至关重要的作用。多项研究证实，COVID-19患者的粪便微生物组发生了显著变化，最显著的是微生物多样性的减少、条件致病菌的富集以及有益共生菌的消耗。这种变化与疾病的严重程度有关，可以通过改善患者微生物组的多样性来促进疾病恢复(Gastroenterology,2020；Gut,2021)。

人类肠道含有一定比例的真菌，且肠道真菌已被证明与微生物组的组装、生态和免疫发育有因果关系。Zuo等人研究了COVID-19患者住院期间的肠道真菌菌群，发现机会性真菌病原体(如白色念珠菌、耳念珠菌和黄曲霉)的比例增加(Gastroenterology，2020)。然而，对从COVID-19中康复的个人的长期真菌微生物群随访仍然是空白的。粪便微生物中关健功能菌可成为人类疾病的新型生物标志物，可能是不同疾病预测和诊断的有力工具。粪便微生态的特征或者基于粪便微生物建立的区别模型作为特定疾病或肿瘤的区分工具正越来越多被广泛报道和认可。然而，用于评估COVID-19患者康复1年后中和抗体水平的粪便真菌微生物模型还未曾报道过。

发明内容

本发明提供了一种用于评估COVID-19患者康复1年后中和抗体水平的粪便真菌微生物基因标志物(微生物基因评估模型)，由SEQ ID NO:1-18所示的18种微生物基因组成，所述微生物基因在人体粪便中富集。

18种微生物基因序列如下：

OTU4