[发明专利]一种用于评估食管癌患者Toll样受体相关基因评分和预后的试剂盒在审
| 申请号： | 202310431266.0 | 申请日： | 2023-04-20 |
| 公开（公告）号： | CN116334229A | 公开（公告）日： | 2023-06-27 |
| 发明（设计）人： | 程涛;杨蕙沁;黄小龙;胥丰恺;古杰;詹成;葛棣 | 申请（专利权）人： | 复旦大学附属中山医院 |
| 主分类号： | C12Q1/6886 | 分类号： | C12Q1/6886;C12N15/11;C12Q1/6851 |
| 代理公司： | 上海申汇专利代理有限公司 31001 | 代理人： | 翁若莹 |
| 地址： | 200032 *** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 用于 评估 食管癌 患者 toll 受体 相关 基因 评分 预后 试剂盒 | ||
1.一种检测试剂在制备用于评估食管癌患者Toll样受体相关基因评分和预后的试剂盒中的应用，其特征在于，所述检测试剂由检测样本中以下基因表达量的试剂组成：CD36，LGR4，MAP2K3，NINJ1，PIK3R1和TRAF3；所述检测试剂作为试剂盒实现评估食管癌患者Toll样受体相关基因评分的唯一关键成分。
2.如权利要求1所述的应用，其特征在于，所述试剂盒包括：用于特异性扩增所述基因CD36，LGR4，MAP2K3，NINJ1，PIK3R1和TRAF3的引物对。
3.如权利要求2所述的应用，其特征在于，用于特异性扩增所述基因CD36的引物对序列如SEQ ID NO:1～2所示；用于特异性扩增所述基因LGR4的引物对序列如SEQ ID NO:3～4所示；用于特异性扩增所述基因MAP2K3的引物对序列如SEQ ID NO:5～6所示；用于特异性扩增所述基因NINJ1的引物对序列如SEQ ID NO:7～8所示；用于特异性扩增所述基因PIK3R1的引物对序列如SEQ ID NO:9～10所示；用于特异性扩增所述基因TRAF3的引物对序列如SEQ ID NO:11～12所示。
4.如权利要求2所述的应用，其特征在于，所述试剂盒包括：总RNA抽提试剂和/或逆转录试剂。
5.如权利要求1所述的应用，其特征在于，所述试剂盒内还包括说明书，所述说明书记载如下评分公式和评估标准：
Score＝CD36×(0.3168041)+LGR4×(-0.4241235)+MAP2K3×(-0.1846531)+NIN J1×(-0.5282817)+PIK3R1×(-0.3430468)+TRAF3×(-0.4578577)；其中，每个基因代表的是该基因表达量的log2(FPKM+1)变换值；
所述评分公式的截断值为0.12，当检测样本评分＜0.12时，代表食管癌患者预后较好，当检测样本评分≥0.12时，代表食管癌患者预后较差。
6.如权利要求1所述的应用，其特征在于，所述检测样本为食管癌患者新鲜肿瘤组织。
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