[发明专利]一种用于评估食管癌患者Toll样受体相关基因评分和预后的试剂盒

说明书

本发明公开了一种用于评估食管癌患者Toll样受体相关基因评分和预后的试剂盒。本发明试剂盒包括用于检测基因CD36、LGR4、MAP2K3、NINJ1、PIK3R1和TRAF3的试剂，本发明首先基于生物信息学分析，得到了通过检测食管癌患者基因以评估Toll样受体相关基因评分的方法显著相关的6个基因，并基于这6个基因构建了相应的评分模型，通过ROC曲线获得了评分截断值，该评分模型用于评估实际患者的预后情况显示出良好的准确性，因此，本发明的试剂盒可通过临床上已广泛应用的RNA测序技术判定食管癌患者肿瘤组织的基因序列，并通过测序结果计算基因的表达量，具有经济实惠，准确性高、灵敏度和特异性好的优点。

技术领域

本发明涉及一种用于评估食管癌患者Toll样受体(Toll-like-receptor)相关基因评分和预后的试剂盒，属于分子诊断技术领域。

背景技术

食管癌是一种非常常见的恶性肿瘤，在全世界范围内，食管癌的死亡率排名第六(占死于癌症总人数的5.3％)。食管癌主要亚型为食管鳞癌，约90％的食管癌为食管鳞癌(ESCC)。对于食管癌的诊断及预后评估依然有待提高。如何能够准确评估食管癌的分子特征，对于患者的精准治疗，预后评估和减轻社会负担意义重大。

Toll样受体(TLRs)是一个模式识别受体家族，共有13个成员。其中10个基因(TLR1到TLR10)来自人类TLR家族。TLR在微生物感染和组织损伤中，其配体和通过先天免疫和后天免疫在免疫激活中起着重要作用。最近的研究发现自体免疫疾病和微生物感染是癌症发展的主要危险因素，是直接的感染源。占全球恶性肿瘤的15％以上。TLR4的高表达预示着ESCC患者有较差的术后预后。TLR9表达增加与食管腺癌分化差和增殖率高有关。些研究表明TLRs作为重要的介质在癌变过程中发挥作用。

然而目前测量食管癌患者基因以评估Toll样受体相关基因评分的检测方法并非临床常规项目，单独检测价格昂贵，仍可能有兼具准确性和应用价值的检测手段可以应用于食管癌患者个体化治疗方案的制定。

目前还没有关于一种检测测量食管癌患者基因以评估Toll样受体相关基因评分和食管癌患者预后的试剂盒的相关报道。

发明内容

本发明的目的是：针对现有技术的不足，提供一种检测食管癌患者基因以评估Toll样受体相关基因评分高低，从而预测食管癌患者预后情况。

为了实现上述目的，本发明提供了一种检测试剂在制备用于评估食管癌患者Toll样受体相关基因评分和预后的试剂盒中的应用，所述检测试剂由检测样本中以下基因表达量的试剂组成：CD36，LGR4，MAP2K3，NINJ1，PIK3R1和TRAF3；所述检测试剂作为试剂盒实现评估食管癌患者Toll样受体相关基因评分的唯一关键成分。

优选地，所述试剂盒包括：用于特异性扩增所述基因CD36，LGR4，MAP2K3，NINJ1，PIK3R1和TRAF3的引物对。

优选地，用于特异性扩增所述基因CD36的引物对序列如SEQ ID NO:1～2所示；用于特异性扩增所述基因LGR4的引物对序列如SEQ ID NO:3～4所示；用于特异性扩增所述基因MAP2K3的引物对序列如SEQ ID NO:5～6所示；用于特异性扩增所述基因NINJ1的引物对序列如SEQ ID NO:7～8所示；用于特异性扩增所述基因PIK3R1的引物对序列如SEQ ID NO:9～10所示；用于特异性扩增所述基因TRAF3的引物对序列如SEQ ID NO:11～12所示。

优选地，所述检测试剂盒包括：总RNA抽提试剂和/或逆转录试剂。

优选地，所述试剂盒内还包括说明书，所述说明书记载如下评分公式和评估标准：