[发明专利]重度抑郁障碍患者血脑一致性差异基因标志物及其应用在审

专利信息
申请号: 202310455456.6 申请日: 2023-04-25
公开(公告)号: CN116463412A 公开(公告)日: 2023-07-21
发明(设计)人: 曾勇;滕兆伟;龙青;余蕾;赵心灵;刘乙霖 申请(专利权)人: 昆明医科大学第二附属医院
主分类号: C12Q1/6883 分类号: C12Q1/6883;G16B50/30;G16H50/20
代理公司: 北京精翰专利代理有限公司 11921 代理人: 刘晓晖
地址: 650106 云南省昆明市五华*** 国省代码: 云南;53
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摘要:
搜索关键词: 重度 抑郁 障碍 患者 一致性 差异 基因 标志 及其 应用
【权利要求书】:

1.一种重度抑郁障碍患者血脑一致性差异基因标志物,其特征在于,所述的标志物为CEP350和SMAD5;

所述的CEP350和SMAD5的确定的步骤如下:

S1、从GEO数据库中下载得到MDD脑组织数据集与外周血组织数据集,并使用GEO2R获取了相应DEGs,在脑组织数据集中使用加权基因共表达网络分析方法提取与疾病相关最多的模块,构建共表达基因网络;

S2、并利用维恩图将模块与外周血样本数据集的共享DEGs进行识别;

S3、通过功能通路预测与疾病最相关的DEGs,由受试者工作特性曲线分析及列线图确定其潜在的诊断价值;

S4、采集男女比例、年龄相匹配的MDD与健康对照的外周血样本,提取RNA后使用实时荧光定量逆转录聚合酶链式反应实验对候选诊断基因的表达情况进行检测,并与脑组织数据集中的表达情况进行比较,最后再次通过ROC曲线分析确定有意义的诊断基因标志物。

2.根据权利要求1所述的重度抑郁障碍患者血脑一致性差异基因标志物,其特征在于:所述的脑组织数据集为GSE53987,所述的GSE53987共有1280个基因被鉴定为DEGs。

3.根据权利要求1所述的重度抑郁障碍患者血脑一致性差异基因标志物,其特征在于:所述的外周血组织数据集为GSE9879,所述的GSE98793共有3864个基因被鉴定为DEGs。

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