[发明专利]重度抑郁障碍患者血脑一致性差异基因标志物及其应用在审
申请号: | 202310455456.6 | 申请日: | 2023-04-25 |
公开(公告)号: | CN116463412A | 公开(公告)日: | 2023-07-21 |
发明(设计)人: | 曾勇;滕兆伟;龙青;余蕾;赵心灵;刘乙霖 | 申请(专利权)人: | 昆明医科大学第二附属医院 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;G16B50/30;G16H50/20 |
代理公司: | 北京精翰专利代理有限公司 11921 | 代理人: | 刘晓晖 |
地址: | 650106 云南省昆明市五华*** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 重度 抑郁 障碍 患者 一致性 差异 基因 标志 及其 应用 | ||
本发明涉及一种重度抑郁障碍患者血脑一致性差异基因标志物及其应用,一种重度抑郁障碍患者血脑一致性差异基因标志物,所述的标志物为CEP350和SMAD5;本发明采用生物信息学及分子生物实验手段相结合的方式,识别了MDD患者脑组织与外周血中共享的DEGs,并在其中挖掘出了可作为MDD诊断的客观生物标志物。基因功能注释显示候选诊断基因可能在MDD的发病机制中起着重要作用,实验结果表明CEP350和SMAD5联合检测对MDD具有一定的诊断价值,该基因组合在临床实践中具有潜在的重要作用。
技术领域
本发明涉及生物技术、生物医药领域,具体是指一种重度抑郁障碍患者血脑一致性差异基因标志物及其应用。
背景技术
抑郁障碍(Depressive disorder)以心境低落为主要特征的一组疾病,全球大约有2.64亿名抑郁障碍患者。根据DSM-5,抑郁障碍包括重性抑郁障
(major depressive disorder,MDD),持续性抑郁障碍
(persistent depressive disorder,PDD),经前期烦躁障碍,破坏性心境失调
(disruptive mood dysregulation disorder),其他躯体疾病所致的抑郁障碍(depressive disorder due to another medical condition),物质/药物所致的抑郁障碍(substance/medication induced depressive disorder)等。其中MDD是最常见的抑郁障碍,临床上常表现为情绪低落,兴趣丧失,快感缺失,意志活动减退等症状,具有反复发作的倾向,严重者可出现自杀念头和行为。
如申请号为CN202210246411.3的发明公开了用于重性抑郁障碍诊断的circRNA标志物及其应用,所述circRNA标志物为circUBE2K,所述circUBE2K的核苷酸序列如
SEQ ID NO:1所示。本发明首次揭示了检测MDD的标志物circUBE2K,且circUBE2K具有高度稳定性、特异性和敏感性;同时研究发现circUBE2K表达越高,症状越重;且本发明中所表达的circUBE2K在MDD患者全血及CUMS小鼠的大脑试样中共同进行高表达,因此,circUBE2K可以作为MDD发生的新的基因靶点。基于此,MDD的诊断可以通过circUBE2K的表达水平这一客观指标进行检查、确诊。
发现精神分裂症,双相情感障碍和重度抑郁症患者中常见的基因组被破坏。研究人员用RNA测序方法鉴定的通常受影响的基因集参与蛋白质的制造,控制脑细胞的通讯并增强免疫系统的反应。利用生物信息学手段对重度抑郁障碍相关数据进行挖掘,识别外周血液与中枢脑组织中变化一致的差异基因,并实施分子生物学实验在生物样本中对候选基因的表达情况进行验证,评估其作为重度抑郁障碍诊断标志物的可行性,以期为重度抑郁障碍的早期识别和精确诊断提供参考。
发明内容
本发明要解决上述技术问题,提供一种重度抑郁障碍患者血脑一致性差异基因标志物及其应用。
为解决上述技术问题,本发明提供的技术方案为:
一种重度抑郁障碍患者血脑一致性差异基因标志物,所述的标志物为CEP350和SMAD5;
所述的CEP350和SMAD5的确定的步骤如下:
S1、从GEO数据库中下载得到MDD脑组织数据集与外周血组织数据集,并使用GEO2R获取了相应DEGs,在脑组织数据集中使用加权基因共表达网络分析方法提取与疾病相关最多的模块,构建共表达基因网络;
S2、并利用维恩图将模块与外周血样本数据集的共享DEGs进行识别;
S3、通过功能通路预测与疾病最相关的DEGs,由受试者工作特性曲线分析及列线图确定其潜在的诊断价值;
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