[发明专利]一种利用长引物快速从头合成目的片段的方法在审
申请号: | 202310534971.3 | 申请日: | 2023-05-12 |
公开(公告)号: | CN116426559A | 公开(公告)日: | 2023-07-14 |
发明(设计)人: | 仲森林;黄利平;祁映璇;管景灏;姚瑶;费正月;刘冠楠 | 申请(专利权)人: | 南京工业大学 |
主分类号: | C12N15/70 | 分类号: | C12N15/70;C12N15/64;C12R1/19 |
代理公司: | 江苏圣典律师事务所 32237 | 代理人: | 仲凌霞;肖明芳 |
地址: | 210009 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 利用 引物 快速 从头 合成 目的 片段 方法 | ||
1.一种利用长引物快速从头合成目的片段的方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)设计合成存在碱基重叠、覆盖整个目的片段的长引物;所述长引物的序列长度为80~100nt,优选为80~90nt,进一步优选为90nt;
(2)使用偶数条步骤(1)获得的长引物交替重叠延伸进行PCR扩增,获得PCR产物;
(3)利用一步法同源重组将步骤(2)获得的PCR产物直接整合到线性化载体中,得到重组产物;
(4)将步骤(3)获得的重组产物转化入感受态细胞,获得带有目的基因的转化子;
所述步骤(1)~步骤(3)总耗时2~5h。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述方法中退火温度为45℃以上。
3.根据权利要求1所述方法,其特征在于,步骤(1)中,所述碱基重叠的重叠长度为18~25bp,优选为18~22bp,进一步优选为20bp。
4.根据权利要求1所述方法,其特征在于,步骤(2)中,所述PCR采用无模板模式,以偶数条步骤(1)所得长引物中重叠交替延伸时最外侧的两条引物作为正/反向外引物,剩余最大偶数条的长引物作为内引物。
5.根据权利要求4所述方法,其特征在于,步骤(2)中,所述PCR的体系由0.5μl终浓度为10nM内引物混合液、1μl终浓度为0.2μM正向外引物、1μl终浓度为0.2μM反向外引物、25μl高保真DNA聚合酶、dNTP以及缓冲液的混合体系,ddH2O补足至50μl组成的;优选地,所述终浓度为10nM内引物混合液为所述内引物均以10nM的浓度等体积混匀后获得。
6.根据权利要求1所述方法,其特征在于,步骤(3)中,所述线性化载体是通过PCR技术利用含有同源臂的引物使载体线性化得到的。
7.根据权利要求1所述方法,其特征在于,步骤(3)中,所述一步法同源重组,其体系包括线性化载体和n个插入片段,5≥n≥1。
8.根据权利要求7所述方法,其特征在于,所述的线性化载体和插入片段的摩尔比是1:1,终浓度为0.03pmol的每个线性化载体/插入片段使用量=[0.02×线性化载体/插入片段碱基对数]ng。
9.根据权利要求1所述方法,其特征在于,步骤(3)中,所述一步法同源重组,其重组时间为30min,重组温度为37℃。
10.根据权利要求1所述方法,其特征在于,步骤(3)中,待重组时间结束后置于4℃保存。
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