[发明专利]一种六妹羊肚菌SSR分子标记、引物组及其应用有效
申请号: | 202310580425.3 | 申请日: | 2023-05-23 |
公开(公告)号: | CN116334298B | 公开(公告)日: | 2023-09-19 |
发明(设计)人: | 刘伟;时晓菲;杨振艳;于富强 | 申请(专利权)人: | 中国科学院昆明植物研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11;C12R1/645 |
代理公司: | 北京高沃律师事务所 11569 | 代理人: | 高辉 |
地址: | 650201 *** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 六妹羊肚菌 ssr 分子 标记 引物 及其 应用 | ||
1.一种六妹羊肚菌SSR分子标记,其特征在于,所述六妹羊肚菌SSR分子标记由以下37个SSR分子标记组成:Msex_82、Msex_713、Msex_709、Msex_692、Msex_658、Msex_650、Msex_621、Msex_620、Msex_615、Msex_576、Msex_558、Msex_553、Msex_548、Msex_546、Msex_54、Msex_523、Msex_519、Msex_5、Msex_491、Msex_49、Msex_455、Msex_426、Msex_367、Msex_332、Msex_279、Msex_247、Msex_246、Msex_235、Msex_213、Msex_209、Msex_194、Msex_193、Msex_177、Msex_173、Msex_159、Msex_116和Msex_10;
所述37个SSR分子标记的引物对的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.38~SEQ ID NO.111所示。
2.权利要求1所述的六妹羊肚菌SSR分子标记在六妹羊肚菌的遗传学分析、育种和种质鉴定中的一种或多种中的应用。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述遗传学分析包括遗传多样性分析、群体遗传结构分析、基因流分析、聚类分析和构建分子指纹图谱中的一种或多种。
4.一种用于六妹羊肚菌遗传学分析的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求1所述37个SSR分子标记的引物对和PCR扩增试剂。
5.一种六妹羊肚菌的遗传学分析方法,其特征在于,包括如下步骤:
以权利要求4所述的引物对对六妹羊肚菌基因组DNA进行PCR扩增,得到扩增产物;
将所述扩增产物进行电泳检测,得到多态性扩增条带;
对所述多态性扩增条带进行遗传学分析。
6.根据权利要求5所述的遗传学分析方法,其特征在于,所述遗传学分析包括遗传多样性分析、群体遗传结构分析、基因流分析和聚类分析。
7.根据权利要求6所述的遗传学分析方法,其特征在于,所述遗传多样性分析包括:计算各SSR分子标记位点的等位基因、有效等位基因、私有等位基因和香农指数中的一种或多种。
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