[发明专利]一种沙门氏菌活菌可视化检测方法在审
申请号: | 202310681374.3 | 申请日: | 2023-06-09 |
公开(公告)号: | CN116590443A | 公开(公告)日: | 2023-08-15 |
发明(设计)人: | 吕远平;朱宇琳;邓锐杰;夏许寒;何强 | 申请(专利权)人: | 四川大学 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6844;C12R1/42 |
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地址: | 610065 四川*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 沙门氏菌 可视化 检测 方法 | ||
1.一种沙门氏菌活菌可视化检测方法,其特征在于,包括如下步骤:(1)从样品中提取总RNA,并将提取的RNA加入RCA反应体系中进行扩增,RCA包括连接反应和扩增反应,反应体系中包含待测RNA、5’端磷酸化锁式探针(padlock)、T4 DNA连接酶缓冲液、T4 DNA连接酶、扩增引物(primer)、dNTP、phi29 DNA聚合酶缓冲液、phi29 DNA聚合酶和水;(2)向RCA反应产物中加入嵌入DNA双链荧光染料DiYO-1,在荧光显微镜下对荧光点进行计数,将沙门氏菌的浓度转换为荧光亮点的个数,从而实现定量检测。
2.根据权利要求1所述的沙门氏菌活菌可视化检测方法,其特征在于,在于以RNA为靶标,从而实现活菌检测。
3.根据权利要求1所述的沙门氏菌活菌可视化检测方法,其特征在于,通过荧光显微镜对RCA扩增产物进行可视化成像计数,一个荧光点代表一个RNA分子,进而高灵敏度、宽线性范围地量化活菌。
4.根据权利要求1所述的沙门氏菌活菌可视化检测方法,其特征在于,RCA反应体系中5’端磷酸化的padlock序列如SEQ ID NO.5~8所示。
5.根据权利要求1所述的沙门氏菌活菌可视化检测方法,其特征在于,RCA反应体系中primer序列如SEQ ID NO.9所示。
6.根据权利要求1所述的沙门氏菌活菌可视化检测方法,其特征在于,RCA连接反应在室温(25 ℃)下进行1~2 h,包含0.5~2 μM磷酸化的padlock,靶标RNA,T4 DNA连接酶缓冲液,0.05~1 U/μL T4 DNA连接酶和水。
7.根据权利要求1所述的沙门氏菌活菌可视化检测方法,其特征在于,RCA扩增在30 ℃下反应0.5~1.5 h,总体积为40 μL,包含连接反应液,0.5~2 μM primer,0.5~2 mM dNTP,phi29 DNA聚合酶缓冲液,0.1~0.5 U/μL phi29 DNA聚合酶。
8.根据权利要求1所述的沙门氏菌活菌可视化检测方法,其特征在于,可实现巴氏杀菌后沙门氏菌活菌的可视化检测。
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