[发明专利]基于分子结构快速筛选环境有机污染物雄激素的方法无效
申请号: | 200710134051.3 | 申请日: | 2007-10-26 |
公开(公告)号: | CN101140289A | 公开(公告)日: | 2008-03-12 |
发明(设计)人: | 肖乾芬;王晓栋;刘树深;杨旭曙;季力;尹大强;王连生 | 申请(专利权)人: | 南京大学 |
主分类号: | G01N35/00 | 分类号: | G01N35/00;G06F19/00 |
代理公司: | 南京知识律师事务所 | 代理人: | 汪旭东 |
地址: | 210093*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | 本发明公开了基于分子结构快速筛选环境有机污染物雄激素的方法,属于环境内分泌干扰物的筛选方法领域。本发明首先是将化合物按结构分成了具有代表性的6类化合物,利用Dragon软件分别计算结构信息参数,并将这些化合物进行活性分类,利用QASAR模型来建立判别函数及类别重心,对于含有芳香环的有机化合物,根据结构判断是属于6类结构中的哪一类,再使用dragon软件算出对应结构类中判别函数里所含的参数值,并将参数值带入判别函数进行计算,根据结果进行判定。可以快速、简便、价廉的利用本发明技术初步判定其是否属于环境雄激素,可以节约大量的实验,也可节约大量的人力和财力,准确率可达83.3%以上。 | ||
搜索关键词: | 基于 分子结构 快速 筛选 环境 有机 污染物 激素 方法 | ||
【主权项】:
1.一种基于分子结构快速筛选环境有机污染物雄激素的方法,其主要包括以下步骤:(A)化合物按结构进行分类,从文献中获得113个有实验数据LogRBA值及其结构的化合物;并利用ChemOffice软件画出所有化合物的二维和三维结构,按含有类苯环类化合物的结构特征,根据结构相似性原理将化合物按结构进行分类,将含有苯环化合物按结构分成了具有代表性的6类化合物,其各类化合物的母环结构如下:
(B)利用Dragon软件分别计算这6类化合物的结构信息参数;(C)在分好的每一类化合物中随机抽取训练组和检验组;(D)将各类化合物中计算所得的结构信息参数、对应的LogRBA值和活性分类数据转导入SPSS软件,利用逐步判别分析方法对各类化合物中的训练组进行QSAR模型建立,并得到各类化合物的QASAR模型判别函数及类别重心,即:1)Y1=84.027PW3+1.349LOP-28.772 其重心分别为:2--0.467;3 1.6352)此类化合物共12个雄激素,活性均属第二类2--弱活性,不必建立判别函数,可以直接判断;3)Y3=7.492NS+2.641TI2-7.535 重心分别为2--0.761;3-4.822;4)Y4=2.106IDE-1.587IDDE 重心分别为2-0.504;3-1.614;5)Y5=151.969PW4-25.506 重心分别为2-0.420;3--2.102;6)Y6=1912JHETV-0.702Maxdp-1.522 重心分别为2--0.541;3-1.760;(E)对于含有类苯环类的有机化合物,根据结构判断是属于所分成的6类结构中的哪一类,若属于第①类,则根据第①类的判别函数和类别重心来进行判断,若属于第②类,则根据第②类的判别函数和类别重心来进行判断,依次类推;(F)再算出该化合物对应结构类中判别函数里所含的参数值,并将参数值带入判别函数进行计算,得到Y值,再计算Y值与各类别重心的差,即欧氏距离d,按距离最小原则判归到最近的类中;1类为强活性,其LogRBA值大于等于零,2类为弱活性,其LogRBA值在0~-4之间,3类为无活性,其LogRBA值小于等于-4,若是属于第1、2类,则说明该化合物是环境雄激素,若是属于第3类,则说明该化合物不是环境雄激素。
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