[发明专利]鱼类种质资源遗传分析装置无效
申请号: | 200710144749.3 | 申请日: | 2007-12-05 |
公开(公告)号: | CN101251873A | 公开(公告)日: | 2008-08-27 |
发明(设计)人: | 匡友谊;孙效文;尹家胜 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院黑龙江水产研究所 |
主分类号: | G06F19/00 | 分类号: | G06F19/00;G06F9/44 |
代理公司: | 哈尔滨市松花江专利商标事务所 | 代理人: | 王吉东 |
地址: | 150070黑龙*** | 国省代码: | 黑龙江;23 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | 鱼类种质资源遗传分析装置,涉及到分子生物学DNA分子标记数据分析技术领域。它解决了现有鱼类种质资源遗传分析过程中,需要根据使用功能软件的要求人工转换分子标记数据格式及分别调用各种功能软件的问题。本发明将现有多个分子标记分析软件集成到一起,通过建立工程文件实现多个分析软件联合使用的目的,通过格式转换装置使原本使用多种格式文件的多个分析软件能够采用一种格式的输入文件实现多种分析、获得多种分析结果的目的。本发明可以作为群体遗传多样性及遗传结构等方面研究的一个基本工具,推广应用到濒危鱼类保护、野生资源评估、养殖鱼类遗传指导、鱼类遗传育种等领域。 | ||
搜索关键词: | 鱼类 种质 资源 遗传 分析 装置 | ||
【主权项】:
1、鱼类种质资源遗传分析装置,其特征在于它由以下部分组成:用于将指定的由分子标记检测获得的电泳图谱转换成0,1矩阵的Excel格式的分子标记文件的数据输入装置;用于设置数据分析处理步骤及各步骤的处理参数形成工程文件,进而为调用装置提供工作顺序流程的工程建立装置;用于将数据输入装置获得的0,1矩阵的Excel格式的分子标记文件转换成分析装置中各个分析软件模块需要的输入格式文件的格式转换装置;用于根据工程建立装置形成的工程文件调用分析装置中的分析软件模块的调用装置;用于对分子标记数据进行分析的分析装置;其中所述数据分析装置包括:用于完成哈代温博格平衡、群体分化、连锁不平衡、基因流参数分析的Genepop软件模块;用于对基因频率、基因型频率、等位基因数目、杂合度、群体自交系数及遗传分化、基因流参数进行分析的PopGene软件模块;用于处理包括核酸序列、分子标记数据、包括形态学数据在类的离散或连续分布的数据,完成鱼类种质资源的群体或品种演化相关分析的Phylip系列软件模块;用于完成鱼类种质资源遗传群体的确定及群体、个体的亲缘分配,获得群体迁徙路线、群体分化程度、群体演化等结果分析的Structure软件模块。
下载完整专利技术内容需要扣除积分,VIP会员可以免费下载。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,未经中国水产科学研究院黑龙江水产研究所许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
本文链接:http://www.vipzhuanli.com/patent/200710144749.3/,转载请声明来源钻瓜专利网。
- 同类专利
- 专利分类
G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用