[发明专利]量化HIV表型或趋向性试验无效
申请号: | 200780004470.3 | 申请日: | 2007-02-02 |
公开(公告)号: | CN101379502A | 公开(公告)日: | 2009-03-04 |
发明(设计)人: | L·J·斯图耶;K·范贝伦;I·I·范登布罗克 | 申请(专利权)人: | 沃尔科公司 |
主分类号: | G06F19/00 | 分类号: | G06F19/00;C12Q1/68 |
代理公司: | 中国专利代理(香港)有限公司 | 代理人: | 程淼;付磊 |
地址: | 比利时*** | 国省代码: | 比利时;BE |
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摘要: | 本发明涉及用于预测感染人类免疫缺陷病毒(HIV)的患者的量化表型例如gag-表型、整合酶表型或趋向性的方法。 | ||
搜索关键词: | 量化 hiv 表型 向性 试验 | ||
【主权项】:
1.用于预测感染HIV的患者的量化表型例如gag-表型、整合酶表型或趋向性的方法,所述方法包括a)使用来自所述患者的含有病毒基因材料的样品;b)从所述样品中提取病毒基因材料,随后进行单基因组测序,包括以下步骤:1.特定HIV区域的病毒基因材料的扩增2.扩增子完整性的分析和样品收集3.所收集的扩增子的纯化4.将扩增子集合连接到载体中并将所连接的产物转化入感受态细胞5.获得的各个转化体的分析6.对所得单克隆进行测序以得到单克隆基因型序列;c)利用预测算法使用所述基因型序列对具体表型例如gag-表型、整合酶表型或趋向性进行预测,包括以下步骤:1.在所述基因型序列中鉴定基因模式,其中至少一种自然变异、获得性变异、药物选择突变或突变模式与所述量化表型结果,例如gag表型、整合酶表型或趋向性相关,
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