[发明专利]线粒体测序用26对PCR引物及基于该引物的分型方法无效
申请号: | 200810017975.X | 申请日: | 2008-04-15 |
公开(公告)号: | CN101270390A | 公开(公告)日: | 2008-09-24 |
发明(设计)人: | 李生斌;刘清波;赖江华;张洪波;杨丽 | 申请(专利权)人: | 西安交通大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 西安通大专利代理有限责任公司 | 代理人: | 惠文轩 |
地址: | 710049*** | 国省代码: | 陕西;61 |
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摘要: | 本发明涉及一种核酸检测方法,特别是公开了一种线粒体全部碱基序列分型及其测定方法,具体而言是线粒体测序用26对PCR引物及基于该引物的分型方法。本发明选用的26对PCR引物覆盖了线粒体基因组全长,其中引物15-1、15-2、15-3、24-1、24-2针对中国人群重新设计,对中国人群的分型具有针对性;引物24-1对应的扩增片段最小,为420bp;引物22对应的扩增片段最大,为1162bp;所有PCR片段大小适中,均适宜PCR扩增。本发明的26对PCR引物已在申请人的实验室应用于中华民族群体遗传资料调查,已向GENEBANK数据库提交了中国人群线粒体全序列资料。结果表明,本发明完全可以应用在法医学、人类学、遗传学和疾病等领域的个体识别、亲子鉴定以及基因诊断等领域。 | ||
搜索关键词: | 线粒体 测序用 26 pcr 引物 基于 方法 | ||
【主权项】:
1、线粒体测序用26对PCR引物,包括引物1 1F CTCCTCAAAGCAATACACTG 3′结合位点611 1R TGCTAAATCCACCTTCGACC 3′结合位点1411引物2 2F CGATCAACCTCACCACCTCT 3′结合位点1245 2R TGGACAACCAGCTATCACCA 3′结合位点2007引物3 3F GGACTAACCCCTATACCTTCTGC 3′结合位点1854 3R GGCAGGTCAA TTTCACTGGT 3′结合位点2669引物4 4F AAATCTTACCCCGCCTGTTT 3′结合位点2499 4R AGGAATGCCATTGCGATTAG 3′结合位点3346引物5 5F TACTTCACAAAGCGCCTTCC 3′结合位点3169 5R ATGAAGAATAGGGCGAAGGG 3′结合位点3961引物6 6F TGGCTCCTTTAACCTCTCCA 3′结合位点3796 6R AAGGATTATGGATGCGGTTG 3′结合位点4854引物7 7F ACTAATTAATCCCCTGGCCC 3′结合位点4485 7R CCTGGGGTGGGTTTTGTATG 3′结合位点5420引物8 8F CTAACCGGCTTTTTGCCC 3′结合位点5255 8R ACCTAGAAGGTTGCCTGGCT 3′结合位点6031引物9 9F GAGGCCTAACCCCTGTCTTT 3′结合位点5855 9R ATTCCGAAGCCTGGTAGGAT 3′结合位点6642引物10 10F CTCTTCGTCTGATCCGTCCT 3′结合位点6469 10R AGCGAAGGCTTCTCAAATCA 3′结合位点7315引物11 11F ACGCCAAAATCCATTTCACT 3′结合位点7148 11R CGGGAATTGCATCTGTTTTT 3′结合位点8095引物12 12F ACGAGTACACCGACTACGGC 3′结合位点7937 12R TGGGTGGTTGGTGTAAATGA 3′结合位点8797引物13 13F TTTCCCCCTCTATTGATCCC 3′结合位点8621 13R GTGGCCTTGGTATGTGCTTT 3′结合位点9397引物14 14F CCCACCAATCACATGCCTAT 3′结合位点9230 14R TGTAGCCGTTGAGTTGTGGT 3′结合位点10130引物17 17F TCACTCTCACTGCCCAAGAA 3′结合位点11314 17R GGAGAATGGGGGATAGGTGT 3′结合位点12076引物18 18F TATCACTCTCCTACTTACAG 3′结合位点11948 18R AGAAGGTTATAATTCCTACG 3′结合位点12772引物19 19F AAACAACCCAGCTCTCCCTAA 3′结合位点12571 19R TCGATGATGTGGTCTTTGGA 3′结合位点13507引物20 20F ACATCTGTACCCACGCCTTC 3′结合位点13338 20R AGAGGGGTCAGGGTTCATTC 3′结合位点14268引物21 21F GCATAATTAAACTTTACTTC 3′结合位点14000 21R AGAATATTGAGGCGCCATTG 3′结合位点14998引物22 22F TGAAACTTCGGCTCACTCCT 3′结合位点14856 22R AGCTTTGGGTGCTAATGGTG 3′结合位点15978引物23 23F TCATTGGACAAGTAGCATCC 3′结合位点15811 23R GAGTGGTTAATAGGGTGATAG 3′结合位点5其特征在于,还包括:引物15-1 15-1F CTTCTATTGATGAGGGTCTT 3′结合位点9991 15-1R GGTGTTGAGGGTTATGAGA 3′结合位点10622引物15-2 15-2F AAGGATTAGACTGAACCGAA 3′结合位点10404 15-2R CTGATTGTGAGGGGTAGGA 3′结合位点10992引物15-3 15-3F CAACCACCCACAGCCTAA 3′结合位点10857 15-3R TTGAGAATGAGTGTGAGGCG 3′结合位点11512引物24-1 24-1F CATTATCCCGCACAAGAGTG 3′结合位点16419 24-1R TGGAAAGTGGCTGTGCAGACAT 3′结合位点250引物24-2 24-2F CTTTGATTCCTGCCTCATCC 3′结合位点13224-2R TAGAAAGGCTAGGACCAAACCT 3′结合位点652该26对PCR引物覆盖了线粒体基因组全长,其中引物15-1、15-2、15-3、24-1、24-2对中国人群的分型具有针对性。
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