[发明专利]食源性致病菌分子检测标记的建立方法无效
| 申请号： | 200810032391.X | 申请日： | 2008-01-08 |
| 公开（公告）号： | CN101343662A | 公开（公告）日： | 2009-01-14 |
| 发明（设计）人： | 刘战民;尹京苑 | 申请（专利权）人： | 上海大学 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68;C12Q1/04 |
| 代理公司： | 上海上大专利事务所（普通合伙） | 代理人： | 何文欣 |
| 地址： | 200444*** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 本发明涉及一种食源性致病菌分子检测标记的建立方法。该方法的具体步骤为：收集一种食源性致病菌的所有基因组序列；选取基因组序列中的任一基因组切分成长度为500～1000bp的片段，将每个切分片段与该种食源性致病菌其他的基因组序列进行比对，保留相似性达到98％以上的切分片段，得到该种食源性致病菌保守序列片段；将保守序列片段中的任一片段与其他微生物基因组序列进行比对，剔除保守序列片段中与其他微生物基因组序列相同的片段，则保留下来的序列片段即为该种食源性致病菌的特异性标记群；将特异性标记群中的数据信息进行筛选，得到该食源性致病菌分子检测标记。本发明首次提出了利用生物信息学和微生物基因组学相结合发掘食源性致病菌分子检测标记的方法，所得到的检测标记的特异性比现有的分子检测标记的特异性要高，且本发明不需要进行分子克隆、基因测序、PCR等分子生物学实验，可以节约财力。 | ||
| 搜索关键词： | 食源性 致病菌 分子 检测 标记 建立 方法 | ||
【主权项】：
1、一种食源性致病菌分子检测标记的建立方法，其特征在于该方法的具体步骤为：a.收集一种食源性致病菌的所有基因组序列；b.选取步骤a中获得的基因组序列中的任一基因组切分成长度为500～1000bp的片段，将每个切分片段与其余的基因组序列进行比对，保留相似性达到98％以上的切分片段，得到保守序列片段；c.将步骤b获得的保守序列片段中的任一片段与其他微生物基因组序列进行比对，剔除保守序列片段中与其他微生物基因组序列相同的片段，则保留下来的序列片段即为该食源性致病菌的特异性标记群；d.将步骤c获得的特异性标记群中的数据信息进行筛选，得到食源性致病菌分子检测标记。
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