[发明专利]盐屋霉素的生物合成基因簇

摘要

本发明是一种由链霉菌产生的具有抗革兰氏阳性菌抗生素-盐屋霉素(Siomycin)的生物合成基因簇的克隆、测序、分析、功能研究及其应用。整个基因簇共包含21个基因：10个与盐屋霉素大环生物合成相关基因，8个与侧链生物合成相关基因。通过对上述生物合成基因的遗传操作可阻断盐屋霉素的合成。本发明所提供的基因及其蛋白也可以用来寻找和发现可用于医药、工业或农业的化合物或基因、蛋白。

主权项

1. 一种抗革兰氏阳性菌活性的抗生素—盐屋霉素的生物合成基因簇，其特征在于编码盐屋霉素生物合成所涉及的21个基因，具体为：1)1个氨基转移酶基因，即sioA：sioA位于基因簇核苷酸序列第11552-10491个碱基处，长度为1062个碱基对，氨基转移酶，353个氨基酸；2)脂肪酶基因，即sioB：sioB位于基因簇核苷酸序列第12421-11597个碱基处，长度为825个碱基对，编码脂肪酶，274个氨基酸；3)天门冬酰胺合成酶基因，即：sioCsioC位于基因簇核苷酸序列第14359-12500个碱基处，长度为1860个碱基对，编码天门冬酰胺合成酶，619个氨基酸；4)酯环化酶基因，即基因sioD：sioD位于基因簇核苷酸序列第个14789-14382碱基处，长度为408个碱基对，编码酯环化酶，135个氨基酸；5)酰基-CoA脱氢酶基因，即sioE：sioE位于基因簇核苷酸序列第16066-14834个碱基处，长度为1233个碱基对，编码酰基-CoA脱氢酶，410个氨基酸；6)甲基转移酶基因，即sioF：sioF位于基因簇核苷酸序列第16974-16090个碱基处，长度为885个碱基对，编码甲基基转移酶，294个氨基酸；7)具体功能未知的基因，即：sioG：sioG位于基因簇核苷酸序列第17554-17000个碱基处，长度为555个碱基对，编码一个未知功能蛋白，184个氨基酸；8)前体肽基因，即sioH：sioH位于基因簇核苷酸序列第17889-18074个碱基处，长度为186个碱基对，编码Siomycin前体肽，61个氨基酸；9)水解酶基因，即sioI：sioI位于基因簇核苷酸序列第18770-19555个碱基处，长度为786个碱基对，编码水解酶，261个氨基酸；10)脱水酶基因，即sioJ：sioJ位于基因簇核苷酸序列第19548-22196个碱基处，长度为2649个碱基对，编码脱水酶，882个氨基酸；11)脱水酶基因，即sioK：sioK位于基因簇核苷酸序列第22193-23197个碱基处，长度为1005个碱基对，编码脱水酶，334个氨基酸；12)催化D-A反应酶基因，即sioL：sioL位于基因簇核苷酸序列第23194-24306个碱基处，长度为1113个碱基对，编码一个具体功能未知的蛋白，370个氨基酸；13)NADH依赖的氧化酶基因，即sioM：sioM位于基因簇核苷酸序列第24303-25967个碱基处，长度为1665个碱基对，编码NADH依赖的氧化酶，554个氨基酸；14)与Siomycin大环合成相关具体功能未知基因，即sioN：sioN位于基因簇核苷酸序列第25964-27676个碱基处，长度为1713个碱基对，编码一个具体功能未知的蛋白，570个氨基酸；15)环化酶基因，即sioO：sioO位于基因簇核苷酸序列第27673-29616个碱基处，长度为1944个碱基对，编码一个具体功能未知的蛋白，647个氨基酸；16)细胞色素P450氧化酶基因，即sioP：sioN位于基因簇核苷酸序列第29594-30943个碱基处，长度为1350个碱基对，编码细胞色素P450氧化酶，449个氨基酸；17)酰基-CoA合成酶，即sioQ：sioQ位于基因簇核苷酸序列第30919-32220个碱基处，长度为1302个碱基对，编码酰基-CoA合成酶，433个氨基酸；18)细胞色素P450氧化酶基因，即sioR：sioR位于基因簇核苷酸序列第32192-33424个碱基处，长度为1233个碱基对，编码细胞色素氧化酶，410个氨基酸；19)脱水酶基因，即sioS：sioS位于基因簇核苷酸序列第33412-36018个碱基处，长度为2607个碱基对，编码脱水酶，868个氨基酸；20)硫腺苷甲硫氨酸转移酶基因，即sioT：sioT位于基因簇核苷酸序列第36030-37805个碱基处，长度为1776个碱基对，编码一个硫腺苷甲硫氨酸转移酶，591个氨基酸；21)短链脱氢酶基因，即sioU：sioU位于基因簇核苷酸序列第37802-38569个碱基处，长度为768个碱基对，编码一个脱氢酶，255个氨基酸。