[发明专利]用于微阵列制备的基于3′的测序方法

摘要

本发明描述了获得用于制备核酸微阵列的设计序列的方法。本发明的方法使用组织样品或疾病状态中转录本的高通量3′-测序来设计用于核酸微阵列的探针。本发明还描述了具有针对组织中转录本3′-最末端的探针的核酸微阵列。这些微阵列优选代表了特异于获得所述转录本的组织的可变聚腺苷酸化序列。本发明还描述了使用针对转录本3′-最末端的微阵列来评价组织中基因表达的方法，此方法中的假阳性和假阴性结果减少。

主权项

设计核酸微阵列的方法，所述方法包括：从组织样品中分离RNA；从转录本的3′-末端对组织样品中的转录本测序，直到基本上所有转录本都进行了测序，从而获得所述转录本的3′-最末端序列；使用所述序列设计用于微阵列的探针；和制备微阵列，所述微阵列具有针对组织样品中转录本的3′-最末端的探针。