[发明专利]栎枯萎病菌的巢式PCR检测方法无效
申请号: | 200910034195.0 | 申请日: | 2009-09-02 |
公开(公告)号: | CN101691605A | 公开(公告)日: | 2010-04-07 |
发明(设计)人: | 吴翠萍;陈贯源;粟寒;李彬;郑斯竹;安榆林;叶建仁 | 申请(专利权)人: | 江苏出入境检验检疫局动植物与食品检测中心 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/645 |
代理公司: | 南京众联专利代理有限公司 32206 | 代理人: | 王荷英 |
地址: | 210001*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | 本发明涉及一种通过原木、木质包装等携带传播的栎枯萎病菌的巢式PCR检测方法。本方法设计一对鉴别栎枯萎病菌的特异性引物CF01/CF02,以样品DNA作为模板,利用通用引物ITS1/ITS4进行第一轮PCR扩增,再以第一轮PCR产物为模板,进行第二轮特异性引物的PCR扩增,扩增产物进行电泳检测,如果存在280bp的DNA特异性条带,则确定所检测的病菌为栎枯萎病菌。本检测方法即使在微量病原菌存在的情况下,都可以准确的检出,灵敏度为1pg DNA,应用于土壤中检测病菌时,只要有1个病原孢子存在,即可检测出,可靠性强,适用于口岸苗木及木质包装中栎枯萎病菌的快速检测。 | ||
搜索关键词: | 枯萎 病菌 pcr 检测 方法 | ||
【主权项】:
种栎枯萎病菌的巢式PCR检测方法,提取栎枯萎病菌样品的DNA,-20℃保存备用,其特征是,设计鉴别栎枯萎病菌的特异性引物CF01/CF02,其序列为:上游引物CF01:5’-GGCAGGGACTTCTTTCTT-3’;下游引物CF02:5’-AAGGCTTGAGTGGTGAAA-3’;利用通用引物ITS1/ITS4和特异性引物CF01/CF02,进行栎枯萎病菌的Nested PCR扩增,扩增步骤如下:第一轮扩增:通用引物PCR扩增反应体系总体积为25μl,反应组分为:10×的反应缓冲液2.5μl,25mM的MgCl22.5μl,2.5mM的dNTP 2.5μl,10μM的上下游引物ITS1/ITS4各1μl,5U/μl Taq DNA聚合酶0.25μl,模板栎枯萎病菌样品DNA提取液1μl,灭菌水补足25μl;扩增反应程序为:预扩增95℃180秒,接着94℃30秒,50℃30秒,72℃60秒,20个循环,最后在72℃延伸300秒;第二轮扩增:特异引物PCR扩增反应体系总体积为25μl,将第一轮PCR产物稀释10倍,取1μl作为模板,其它反应组分:10×的反应缓冲液2.5μl,25mM MgCl2 2.5μl,2.5mM dNTP 2.5μl,10μM的上下游引物CF01/CF02各1μl,5U/μl Taq DNA聚合酶0.25μl,灭菌水补足25μl;扩增反应程序为:预扩增95℃180秒,接着94℃30秒,60℃30秒,72℃60秒,35个循环,最后在72℃延伸300秒;扩增产物进行电泳检测:取8μl第二轮PCR扩增产物,采用1.5%(质量/体积)琼脂糖凝胶,在电压150V下电泳30分钟,之后置于EB内染色20分钟,取出,于凝胶成像系统下拍照检测,如果存在280bp的DNA特异性条带,则确定所检测的病菌为栎枯萎病菌。
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