[发明专利]中国人群连锁分析SNP标记集合及其使用方法与应用

摘要

中国人群连锁分析SNP标记集合及其使用方法与应用在国际人类基因组单体型计划产生的海量数据中有上亿份涉及中国汉族人群的数据成果基础上，根据连锁不平衡性质、多态性程度、分型成功率、基因组分布位置与密度、功能特性等多参量的统计比较和多层次挑选与实验验证，构建并优化了分别含有3000和6001位点的中、高密度两套连锁分析用SNP标记集合。其中3000位点包含于6001位点中。该SNP集合在设计上强调针对汉族的遗传背景，使其在中国人中具有高多态性，从而达到具有我国家系样本基因组标记的高效性这一目标。多态位点的选择基于中性进化原则，全部位点位于非基因功能区以避免进化对于基因功能的影响。同时，标记位点的高可分型检测性、均匀覆盖全基因组等特点为完整筛查整个基因组进而定位和发现新的致病基因提供了可靠保障。用这两套SNP标记订制探针或芯片针对家系样本进行全基因组基因分型，并用分型数据做连锁分析，辅以连锁候选区域的单体型分析和精细定位，能够以较低的费用和较快的速度得到比传统方法更为精细的定位结果。附图为6001 SNP标记集合在人类染色体上的分布和覆盖情况。

主权项

一种用于连锁分析的SNP集合，包括至少100个SNP位点，其特征在于：所述的至少100个SNP位点选自人类基因组。