[发明专利]一种适用于底泥中微生物群落结构分析的DNA提取方法无效

专利信息
申请号: 200910180630.0 申请日: 2009-10-26
公开(公告)号: CN101696410A 公开(公告)日: 2010-04-21
发明(设计)人: 赵大勇 申请(专利权)人: 河海大学
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10;C12Q1/68
代理公司: 南京经纬专利商标代理有限公司 32200 代理人: 李纪昌
地址: 210098*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 一种底泥中微生物群落结构分析的DNA提取方法,提取步骤为:用TENPbuffer清洗底泥样品,将清洗好的底泥样品悬浮于PBS buffer中;将预处理的底泥样品反复冻溶后加入溶菌酶,向底泥样品中加入蛋白酶K和十二烷基磺酸钠,所得样品在室温下离心后取上清液,向其中加入等体积的酚∶氯仿∶异戊醇混合液,振荡混匀,所得样品室温下离心后取液相,向液相中加入等体积的氯仿∶异戊醇混合液,所得样品室温下离心后取液相,向液相中加入预冷的异丙醇;所得样品离心去上清,向沉淀中加入预冷的乙醇洗涤沉淀三次,再离心去乙醇;将样品在空气中自然风干,用TE缓冲液溶解DNA保存。
搜索关键词: 一种 适用于 底泥中 微生物 群落 结构 分析 dna 提取 方法
【主权项】:
一种底泥中微生物群落结构分析的DNA提取方法,其特征在于提取步骤为:a.用TENP buffer清洗底泥样品,将清洗好的底泥样品悬浮于PBSbuffer中;b.将经步骤a预处理的底泥样品在-80℃和65℃反复冻溶后加入溶菌酶,在37℃水浴1h,所述溶菌酶最终浓度为1mg/mL;c.向底泥样品中加入蛋白酶K和十二烷基磺酸钠,在55℃水浴1.5h,所述蛋白酶K最终浓度为0.2mg/mL,所述十二烷基磺酸钠最终浓度为1%(w/v);d.步骤c所得样品在室温下离心后取上清液,向其中加入等体积的酚∶氯仿∶异戊醇混合液,振荡混匀,所述混合液中各物质的体积比为25∶24∶1;e.步骤d所得样品室温下离心后取液相,向液相中加入等体积的氯仿:异戊醇混合液,混合液中氯仿∶异戊醇的体积比为24∶1;f.步骤e所得样品室温下离心后取液相,向液相中加入预冷的异丙醇在-20℃沉淀2h;g.步骤f所得样品在4℃条件下离心去上清,向沉淀中加入预冷的乙醇洗涤沉淀三次,再离心去乙醇;h.将样品在空气中自然风干,用TE缓冲液溶解DNA保存于-20℃。
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