[发明专利]TPMT基因SNP检测的特异性序列、液相芯片及方法有效

专利信息
申请号: 200910193154.6 申请日: 2009-10-19
公开(公告)号: CN101671739A 公开(公告)日: 2010-03-17
发明(设计)人: 许嘉森;何嘉英;杨惠夷 申请(专利权)人: 广州益善生物技术有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 广州华进联合专利商标代理有限公司 代理人: 万志香;曾旻辉
地址: 510663广东省广州市广州科*** 国省代码: 广东;44
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摘要: 发明公开了TPMT基因SNP检测液相芯片、特异性引物和方法,所述液相芯片包括针对每种型别的突变位点分别设计的野生型和突变型特异ASPE引物对、分别包被有特异的anti-tag序列的微球,和用于扩增具有TPMT基因G238C、G460A和/或A719G SNP位点的目标序列的引物。所制备的TPMT基因SNP检测液相芯片具有非常好的信号-噪声比,并且所设计的探针以及anti-tag序列之间基本上不存在交叉反应。本发明设计的ASPE引物具有非常好的特异性,能准确区分各种类型的突变位点。所述检测方法步骤简单,3种突变位点可以一步检测中完成,操作方便,并且避免了多次操作过程中存在的诸多不确定因素,因而可大大提高检测准确率。
搜索关键词: tpmt 基因 snp 检测 特异性 序列 芯片 方法
【主权项】:
1、一种TPMT基因SNP检测液相芯片,其特征是,主要包括有:(1).针对每种型别的SNP位点分别设计的野生型和突变型特异性ASPE引物对,每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端的针对目的基因SNP位点的特异性引物序列组成,针对不同野生型和突变型的特异性引物序列分别选自:SEQ ID NO.7及SEQ ID NO.8、SEQ IDNO.9及SEQ ID NO.10、和/或SEQ ID NO.11及SEQ ID NO.12;所述tag序列选自SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.6中的序列;(2).分别包被有特异的anti-tag序列的微球,所述anti-tag序列能相应地与(1)中所选tag序列互补配对,所述anti-tag序列选自SEQ ID NO.13~SEQ ID NO.18中的序列;(3).用于扩增具有G238C、G460A和/或A719G SNP位点的TPMT基因目标序列的引物。
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