[发明专利]一种基于基因表达谱的用来标示高风险多发性骨髓瘤的基因组指纹的方法和用途

摘要

本发明揭示了一种将新颖的生物信息学和计算机方法学用于数据分析的方法，所述的数据来源于高分辨率的覆盖基因组的比较基因组杂交和基因表达谱分析，所分析的样品是依CD138抗原分选出的多发性骨髓瘤患者的浆细胞，所述的这一组92名患者最近被确诊患有多发性骨髓瘤并接受过大剂量化疗和干细胞移植。结果揭示获取染色体1q处的增加和染色体1p处的减少与所驻基因表达的改变高度关联，其中这些改变与以下时间强烈关联：1种)疾病恶化引起的死亡风险，2)一个基于基因表达的扩增指数，以及3)一个最近被描述的基于基因表示的高风险指数。尤为重要地，染色体8q24处的拷贝数的增加与Argonate 2基因(AGO2，一个编码调控微小RNA表达和成熟的主调控蛋白的基因)表达的增加显著相关，同时也与疾病的结果显著相关。这些新颖的研究结果极大推动了对多发性骨髓瘤的基因组结构，和其基因组结构与临床结果关系的理解。

主权项

一种用以标示与某种疾病患者的生存率相关的基因组指纹的方法，包括：从某人群中的某种疾病患者身上和不患该疾病的个体身上分离浆细胞；从上述浆细胞中提取核酸；将上述核酸杂交至一种比较基因组DNA列阵上和一种基因表达DNA微排阵上以检测上述浆细胞中的基因拷贝数异常和基因表达水平，以及进行包括生物信息学和计算机方法在内的数据分析，以识别可能与疾病相关的候选基因的拷贝数反常性和表达水平的改变，其中所述的表达水平的改变显示这些特定的基因组指纹与该疾病患者的生存率相关。