[发明专利]海草喜盐草微卫星标记的筛选方法无效
申请号: | 201010204001.X | 申请日: | 2010-06-18 |
公开(公告)号: | CN102286457A | 公开(公告)日: | 2011-12-21 |
发明(设计)人: | 徐娜娜;刘敏;陈小勇 | 申请(专利权)人: | 华东师范大学 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C12Q1/68 |
代理公司: | 上海麦其知识产权代理事务所(普通合伙) 31257 | 代理人: | 董红曼 |
地址: | 200062 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本发明公开一种海草喜盐草微卫星标记的筛选方法,首先使用改良的CTAB方法提取喜盐草叶片组织的基因组DNA;再应用生物素链霉亲和素捕获法得到含有微卫星的DNA片段,且对DNA片段进行测序,筛选出碱基重复(2-6个)单元多于5个的DNA序列;然后在微卫星重复序列两端的侧翼序列设计特异性的引物,并对不同地理分布群中的喜盐草个体基因组DNA进行PCR扩增以检测、优化引物;最后对PCR产物片段大小进行分析,确定每个个体的基因型,获得喜盐草的遗传多态性图谱,确定重复性、稳定性和多态性高的微卫星标记。本发明可以用于喜盐草的种质资源鉴定、遗传多样性分析、遗传图谱构建等研究,进一步用于喜盐草海草床的管理、保护和恢复工作。 | ||
搜索关键词: | 海草 喜盐草微 卫星 标记 筛选 方法 | ||
【主权项】:
一种海草喜盐草微卫星标记的筛选方法,包括步骤:1)使用改良的CTAB方法提取喜盐草叶片组织的基因组DNA;2)应用生物素链霉亲和素捕获法得到含有微卫星的DNA片段,并对DNA片段进行测序,筛选2‑6个碱基重复单元、重复数超过5个的DNA序列;3)对上述步骤筛选出的重复序列两端的侧翼序列设计特异性的引物,并对不同地理分布群中的喜盐草个体基因组DNA进行PCR扩增以检测、优化引物;4)对PCR产物片段大小进行分析,确定每个个体的基因型,获得喜盐草的遗传多态性图谱;和5)确定重复性、稳定性和多态性高的微卫星标记。
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