[发明专利]一种大肠癌预后预测模型的建立方法无效
申请号: | 201110069462.5 | 申请日: | 2011-03-22 |
公开(公告)号: | CN102183662A | 公开(公告)日: | 2011-09-14 |
发明(设计)人: | 虞舒静;余捷凯;郑树;葛维挺;胡涵光 | 申请(专利权)人: | 浙江大学 |
主分类号: | G01N33/68 | 分类号: | G01N33/68;G01N33/574 |
代理公司: | 杭州求是专利事务所有限公司 33200 | 代理人: | 张法高;赵杭丽 |
地址: | 310027 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | 本发明提供一种大肠癌预后预测模型的建立方法,通过免疫组化法检测SPARCL1、P53蛋白在大肠癌组织中的表达水平;半定量法将SPARCL1、P53蛋白的组织表达水平分级;SPARCL1、P53蛋白表达水平经支持向量机组合分析并验证,最后建立判别模型。本发明结合免疫组化检测、标志物组合及支持向量机分析,联合应用于建立大肠癌预测模型。研究表明,本发明以SPARCL1与P53组合作为标志物构建模型具有实验辅助预测大肠癌患者预后的作用。可在大肠癌病人术后转移复发危险度预测实验中的应用。 | ||
搜索关键词: | 一种 肠癌 预后 预测 模型 建立 方法 | ||
【主权项】:
一种大肠癌预后预测模型的建立方法,其特征在于,通过以下步骤实现:(1)免疫组化法检测SPARCL1、P53蛋白在大肠癌组织中的表达水平:收集组织蜡块标本→切片→烤箱过夜→脱蜡→水化→抗原修复→自然冷却→洗片→甩干,置湿盒内→滴加内源性过氧化酶阻断剂,静置→洗片→滴加非免疫动物血清,静置→滴加一抗,静置→洗片→滴加生物素标记的二抗, 静置→洗片→滴 加链霉菌抗生物素蛋白‑过氧化酶, 静置→洗片→DAB显色→观察显色后淋洗→细胞核染色→淋洗→分化→自来水淋洗→返蓝→脱水→吹干→封片;(2)半定量法将SPARCL1、P53蛋白的组织表达水平分级:每例标本随机检测 5 个高倍镜视野,分别给阳性范围和染色深度打分:阳性范围分为 0‑4 级:<10%为0级,10%‑25%为1级,25%‑50%为2级,50%‑75%为3级,>75%4级;染色深度分为 0‑3 级:0 为阴性,1 为浅黄色,2为棕黄色,3 为深棕色;最后将前两部分得分相加,最后结果分为 0‑7 级;(3)SPARCL1、P53蛋白表达水平经支持向量机组合分析并验证,建立判别模型:支持向量机采用径向基核函数,Gamma值设为0.6,罚分函数(C)设为19,特征向量的选取采用统计过滤结合模型依赖性筛选的方法,将SPARCL1与P53组合用于支持向量机模型的输入,用十倍交叉验证法评估模型的预测效果,三年生存/死亡,选出建立支持向量机模型预测的约登指数:约登指数=[(灵敏度+特异度)/2+灵敏度] /2),最高的组合作为最终的模型,经十倍交叉验证的预测值作为最终的结果。
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