[发明专利]一种从林木基因组中高通量开发SSR标记的方法有效
申请号: | 201110123288.8 | 申请日: | 2011-05-13 |
公开(公告)号: | CN102226178A | 公开(公告)日: | 2011-10-26 |
发明(设计)人: | 林元震;莫晓勇;陈晓阳;刘纯鑫 | 申请(专利权)人: | 华南农业大学 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12N15/10;C12Q1/68 |
代理公司: | 广州粤高专利商标代理有限公司 44102 | 代理人: | 林丽明 |
地址: | 510642 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明公开了一种从林木基因组中高通量开发SSR标记的方法,具体包括如下步骤:(1)从公共序列库中获取林木基因组序列;(2)开发SSR标记预测程序htmSSR;(3)将htmSSR程序对步骤(1)的林木基因组进行SSR搜索;(4)根据搜索到的SSR序列进行引物设计,经引物多态性检测,得到多态性引物,即为基因组SSR标记。本发明所述方法与传统方法相比,开发效率提高4~6倍,极大减少了工作量和财力消耗,缩短了研发时间,降低了开发成本,同时可为林木高精度的遗传连锁图、精确的品种鉴定等研究提供了大量的有效SSR标记。本发明方法对林木没有特异性,只要该物种基因组已经测序,即可采用本发明方法,故具有广泛的适用性。 | ||
搜索关键词: | 一种 林木 基因组 中高 通量 开发 ssr 标记 方法 | ||
【主权项】:
一种从林木基因组中高通量开发SSR标记的方法,其特征在于包括如下步骤:(1)从公共序列库中获取林木基因组序列;(2)开发SSR标记预测程序htmSSR;(3)将htmSSR程序对步骤(1)的林木基因组进行SSR搜索;(4)根据搜索到的SSR序列进行引物设计,经引物多态性检测,得到多态性引物,即为基因组SSR标记。
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