[发明专利]一种富集分离内源转录因子及其复合物的方法及其专用转录因子串联结合序列

摘要

本发明公开了一种富集分离内源转录因子及其复合物的方法及其专用转录因子串联结合序列。该方法利用转录因子与序列特异性DNA元件结合的特点，设计合成串联各种转录因子的多拷贝双链DNA结合元件，然后通过分子克隆技术在DNA结合元件两端各加入生物素标记的双链DNA手臂，形成“DNA诱饵”，在进行内源转录因子及其复合物的分离纯化时，将纯化好的生物素化DNA诱饵偶联到链亲和素包被的磁珠上，然后与预先制备好的核蛋白一起孵育，从而从核蛋白中分离纯化内源转录因子及其复合物，后续可进一步进行转录因子的质谱鉴定及功能解析。

主权项

一种转录因子串联结合序列，是由3‑5bp的接头序列(Linker)串联的转录因子AP1、AR、BRCA1、CEBPA、CREB1、E2F1、ELK1、ELK4、ESR1、ETS1、EWSR1‑FLI1、FEV、FOXA1、FOXC1、FOXD1、FOXF2、FOXI1、FOXL1、FOX03、Fra‑1、GATA2、GATA3、GR、HIF1A::ARNT、HLF、HNF1B、HNF4A、HOXA5、INSM1、IRF1、IRF2、JunB、JunD、MAX、MEF2A、MIZF、MYC::MAX、Myf、MZF1 1‑4、MZF15‑13、NF‑kappaB、NFATC2、NFE2L2、NFIC、NFIL3、NFKB1、NFYA、NHLH1、NKX3‑1、NR1H2::RXRA、NR2F1、NR3C1、NR4A2、Pax6、PBX1、PDX1、PLAG1、PPARG、PR、PXR‑1:RXR‑alpha、RAR‑alpha、RAR‑alpha:RXR‑gam、RAR‑beta:RXR‑alpha、REL、RELA、REST、RFX1、RFX2、RFX3、RFX5:RFXAP:RFXANK、RORA_1、RORA_2、RREB1、RXR::RAR DR5、RXRA::VDR、SOX10、SOX9、SP1、SPI1、SPIB、SRF、SRY、STAT1、STAT5A、T3R‑beta1、TAL1::TCF3、TBP、TEAD1、TFAP2A、TLX1::NFIC、TP53、USF1、WT1‑del2、WT1‑KTS、WT1I、WT1I‑del2、WT1I‑KTS、XBP‑1、YY1和ZNF354C等DNA结合元件中的一个或多个后得到的DNA序列。