[发明专利]一种检测利玛原甲藻的方法有效

专利信息
申请号: 201210005132.4 申请日: 2012-01-09
公开(公告)号: CN102433390A 公开(公告)日: 2012-05-02
发明(设计)人: 唐晨;董丽;何培民;饶涛;贾睿 申请(专利权)人: 上海海洋大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12Q1/06;G01N21/64
代理公司: 上海伯瑞杰知识产权代理有限公司 31227 代理人: 吴瑾瑜
地址: 201306 上海*** 国省代码: 上海;31
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摘要: 发明涉及生物检测领域,公开一种检测利玛原甲藻的方法。具体为,针对利玛原甲藻的聚酮合酶基因PKS及rDNA ITS序列设计特异性引物和TaqMan探针,利用实时(real-time)PCR方法荧光定量检测。本方法可用于底栖甲藻利玛原甲藻的定量及赤潮快速预警等领域,提高了检测精度,操作简便,易于掌握,可快速检测出水体中的利玛原甲藻。
搜索关键词: 一种 检测 利玛 原甲藻 方法
【主权项】:
一种检测利玛原甲藻的方法,其特征在于,包括如下步骤:(1)用CTAB改良法提取待测水样中的玛原甲藻的基因组DNA;(2)用特异性引物和特异性探针,扩增利玛原甲藻的ITS和PKS序列中的至少一种,采用荧光定量PCR检测方法,对照标准曲线,确定待测水样中玛原甲藻含量;ITS基因序列的特异性引物为:上游cttggaatggcgcaacaagc,下游aaaccacaagacacgatgaaacg;PKS基因序列的特异性引物为:上游atccccagcaacgattattaatgg,下游tgcgtgaaagcgaagagtcc;ITS基因序列的TaqMan探针包括以下核苷酸序列:ccaaacctgccaccgttcctcgct;PKS基因序列的TaqMan探针包括以下核苷酸序列:cggctcgctccaacgcttcccaac。
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