[发明专利]黄牛I‑mfa基因的单核苷酸多态性位点及其检测方法

摘要

本发明公开了黄牛I‑mfa基因的单核苷酸多态性及其检测方法，其基因单核苷酸多态性包括以包含I‑mfa基因的待测黄牛全基因组DNA为模板，以引物对P为引物，PCR扩增黄牛I‑mfa基因，对扩增片段进行聚丙烯酰胺凝胶电泳；根据电泳结果鉴定黄牛I‑mfa基因第12284位为A或G的碱基多态性；在黄牛的I‑mfa基因第12331位为T或C的碱基多态性；这两个位点完全连锁。本发明是一种在DNA水平上筛查和检测与黄牛生长性状密切相关的分子遗传标记，为利用杂种优势进行黄牛杂交育种提供了分子依据。

主权项

黄牛I‑mfa基因的单核苷酸多态性位点的检测方法，其特征在于，包括以下步骤：(1)、以包含I‑mfa基因的待测黄牛全基因组DNA为模板，以引物对P为引物，PCR扩增黄牛I‑mfa基因；所述的引物对P为：上游引物P1：TTCTCCTCCATCGCCCTTTTC；下游引物P2：ATGCTGCTGCCGCTCCCT；(2)、对步骤(1)的扩增产物进行PCR产物的切胶回收及纯化、测序；(3)、对步骤(2)的纯化产物进行PCR‑SSCP检测：首先对纯化的PCR产物用变性剂进行变性处理，再进行聚丙烯酰胺凝胶电泳，然后根据聚丙烯酰胺凝胶电泳结果鉴定其多态性位点的基因型；步骤(3)中根据聚丙烯酰胺凝胶电泳结果鉴定黄牛I‑mfa基因的多态性位点的基因型，所述多态性位点为：黄牛I‑mfa基因第12284位为A或G的碱基多态性位点和黄牛I‑mfa基因第12331位为T或C的碱基多态性位点，表现为AATT、AGTC、GGCC三种基因型；所述第12284位为A或G的碱基多态性位点是指扩增产物5’GGCGGCGCCAGGCGG 3’序列段中第4位为A或G的碱基多态性位点，所述第12331位为T或C的碱基多态性位点是指扩增产物5’CCAAGGCCCATCG 3’序列段中第11位为T或C的碱基多态性位点，AGTC基因型的体重值和胸宽显著高于纯合的黄牛品系。