[发明专利]一种长片段末端文库的构建方法无效
申请号: | 201210357019.2 | 申请日: | 2012-09-24 |
公开(公告)号: | CN102864498A | 公开(公告)日: | 2013-01-09 |
发明(设计)人: | 陈祖耕;姜楠;王萍;暴云娟;刘桂友;陈晓云 | 申请(专利权)人: | 天津工业生物技术研究所 |
主分类号: | C40B40/06 | 分类号: | C40B40/06;C40B50/06;C12Q1/68 |
代理公司: | 青岛海昊知识产权事务所有限公司 37201 | 代理人: | 曾庆国 |
地址: | 300308 天津*** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | 本发明涉及一种长片段末端文库的构建方法,包括有1)DNA随机打断、末端缺口补齐修复;2)制成A-Fragment步骤;3)将A-Fragment与LMP Adaptor进行粘性末端的连接;4)将LMP-Adaptor-Fragment用不少于两种的识别四个碱基的限制性内切酶消化;5)将获得的酶消化文库中的片段再次进行环化;6)将纯化后的环状分子用LMP Adaptor的引物进行扩增,扩增产物回收后完成LMP文库的构建。本发明的建库方法,只需要合成两条63 bp的寡核苷酸序列,进行简单的分子生物学连接、扩增等实验,获得的LMP文库两端带有测序引物序列,能够直接应用于二代测序。此外,由于二次环化后的片段中存在已知的限制性内切酶位点,能够快速分拣待测片段两端的序列,对测序数据进行有效筛选,去除嵌和序列。 | ||
搜索关键词: | 一种 片段 末端 文库 构建 方法 | ||
【主权项】:
一种长片段末端文库的构建方法,其特征在于,所述的方法的步骤如下:1)首先将基因组DNA随机打断,并将打断的DNA进行末端缺口补齐修复;2)将修复的DNA片段的3′端加上脱氧腺苷酸A,制成A‑Fragment;3)将制成A‑Fragment与3′端带有突出的脱氧胸甘酸T的 LMP Adaptor进行粘性末端的连接,获得环状的LMP‑Adaptor‑Fragment;4)将去除了未环化的线性分子的LMP‑Adaptor‑Fragment用不少于两种的识别四个碱基的限制性内切酶消化adaptor以外的区域,获得相应的酶消化文库; 5)将步骤4)获得的酶消化文库中的片段进行末端缺口补齐修复后,按照步骤3)再次进行环化;6)将步骤5)获得的环化产物用核酸外切酶消化去除未环化的线性分子;用纯化后的环状分子作为模版,LMP Adaptor的引物进行扩增,扩增产物回收后完成长片段末端文库的构建。
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