[发明专利]基于SLAFseq技术的大规模样品基因分型方法有效
申请号: | 201210501124.9 | 申请日: | 2012-11-29 |
公开(公告)号: | CN103088120A | 公开(公告)日: | 2013-05-08 |
发明(设计)人: | 郑洪坤 | 申请(专利权)人: | 北京百迈客生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 王朋飞;张庆敏 |
地址: | 101300 北京市*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明提供一种基于SLAF-seq技术进行大规模样品基因分型的方法,其是利用SLAF-seq技术降低基因组的复杂度,并对大规模样品进行基因分型。利用该技术对基因组进行高通量测序,对样品进行标记开发、遗传图谱绘制及全基因组关联分析。该方法与传统的方法相比优点在于通量大幅度提高,成本大幅度降低。该方法主要应用于标记开发、遗传图谱绘制及全基因组关联分析。 | ||
搜索关键词: | 基于 slafseq 技术 大规模 样品 基因 方法 | ||
【主权项】:
基于SLAFseq的大规模样品基因分型方法,其基于SLAFseq技术降低基因组复杂度并进行高通量测序,对大规模样品进行标记开发及遗传图谱绘制、全基因组关联分析,包括如下步骤:1)对经性状鉴定的各样品的DNA进行检测;2)对样品基因组的复杂性进行降低处理,获得复杂性降低的DNA样品;3)利用二级引物库中的引物对复杂性降低后的样品DNA进行PCR扩增,使特异性长度片段扩增前后丰度一致;4)将扩增后的特异性长度片段连接标准测序接头,利用高通量测序方式进行测序;5)比较测序结果,获得SLAF标记,进行遗传图谱绘制或全基因组关联分析。
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