[发明专利]用高同源性寡核苷酸抑制非特异性扩增有效
申请号: | 201280058715.1 | 申请日: | 2012-11-30 |
公开(公告)号: | CN103975076B | 公开(公告)日: | 2017-03-22 |
发明(设计)人: | X.陈;S.程;T.W.迈尔斯;N.帕滕;N.舍恩布伦纳;S-J.C.张 | 申请(专利权)人: | 霍夫曼-拉罗奇有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 中国专利代理(香港)有限公司72001 | 代理人: | 杜艳玲,权陆军 |
地址: | 瑞士*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | 本发明包括用于降低非目标核酸序列的扩增的抑制寡核苷酸;设计和使用此类寡核苷酸的方法,以及试剂盒和反应混合物。 | ||
搜索关键词: | 同源性 寡核苷酸 抑制 非特 异性 扩增 | ||
【主权项】:
设计用于在核酸扩增反应中使用以减少非特异性扩增的抑制寡核苷酸的方法,所述方法包括:(a)鉴定目标生物体的基因组中一个或多个目标区域;(b)对于每个目标区域,使用所述目标区域作为查询进行所述目标基因组序列的搜索来鉴定所述目标区域和所述目标基因组之间的同源性区域;(c)选择在所述目标基因组中具有最多同源性区域的目标区域的区段;(d)在步骤(c)中选择的区段中设计一个或多个寡核苷酸;(e)用步骤(d)中设计的寡核苷酸进行目标基因组的搜索,以鉴定与所述目标基因组具有最高同源性区域数目的寡核苷酸,其中所述同源性区域为至少15个碱基对长,所述寡核苷酸与目标基因组之间的同源性区域具有至少75%同一性,且所述同源性区域跨越所述寡核苷酸的3’‑末端,同时在所述寡核苷酸3'‑末端的4个核苷酸内存在不超过2个错配,且所述寡核苷酸与要在扩增反应中扩增的目标序列不具有互补性区域;(f)选择步骤(e)中鉴定的寡核苷酸作为抑制寡核苷酸。
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