[发明专利]用于同时检测沙门菌枸橼菌变形菌和爱德华菌的多重PCR引物及其设计方法有效

专利信息
申请号: 201310072599.5 申请日: 2013-03-06
公开(公告)号: CN103146827A 公开(公告)日: 2013-06-12
发明(设计)人: 陈琼;孔繁德;徐淑菲;赵冉;周昱;杨涛;陈永锋;连玉华 申请(专利权)人: 厦门市农产品质量安全检验测试中心;厦门出入境检验检疫局检验检疫技术中心
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12Q1/10;C12N15/11
代理公司: 厦门南强之路专利事务所 35200 代理人: 马应森
地址: 361012 福建*** 国省代码: 福建;35
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摘要: 用于同时检测沙门菌枸橼菌变形菌和爱德华菌的多重PCR引物及其设计方法,涉及沙门氏菌等的检测。沙门氏菌引物对应的PCR扩增片段为526bp,弗氏枸橼酸杆菌引物对应的PCR扩增片段为161bp,奇异变形杆菌引物对应的PCR扩增片段为396bp,迟缓爱德华菌引物对应的PCR扩增片段为330bp。1设计多重PCR引物组合;2对引物组合中的引物进行筛选,保留不能合成引物二聚体的引物;3判断所保留引物的竞争优劣状态,将步骤2保留不能合成引物二聚体的引物的GC%和碱基数进行比较,选取GC含量高的判断为竞争状态优势引物,转步骤5;否则转步骤4;4再次筛选竞争状态劣的引物;5对竞争状态优引物扩增。
搜索关键词: 用于 同时 检测 沙门 枸橼 变形 爱德华 多重 pcr 引物 及其 设计 方法
【主权项】:
用于同时检测沙门氏菌、弗氏枸橼酸杆菌、奇异变形杆菌和迟缓爱德华菌的多重PCR引物,其特征在于为:S.spp.F1:5’‑GCCGGTAAACTACACGATGA‑3’;S.spp.R1:5’‑GAGTTACTGAACCAACAGCT‑3’;C.freu.F1:5’‑AACATAGCGATGGACAACTGA‑3’;C.freu.R1:5’‑TTAGCAAAAATTTAAGCCGGT‑3’;P.mira.F1:5’‑TTTATCAATAGCCTCAAACCCT‑3’;P.mira.R1:5’‑TGCGTCACCCTCTAACTCATCC‑3’;E.tarda.F1:5’‑CTGGGCAAGTATCCGACCTC‑3’;E.tarda.R1:5’‑GGTAACCGTATCGGCGTAAG‑3’;其中,S.spp.为沙门氏菌的英文缩写,C.freu.为弗氏枸橼酸杆菌的英文缩写,P.mira.为奇异变形杆菌的英文缩写,E.tarda.为迟缓爱德华菌的英文缩写;S.spp.F1和S.spp.R1为根据沙门氏菌FimA基因设计的上游引物F1和下游引物R1;C.freu.F1和C.freu.R1为根据弗氏枸橼酸杆菌Idh基因设计的上游引物F1和下游引物R1;P.mira.F1和P.mira.R1为根据奇异变形杆菌IdsC基因设计的上游引物F1和下游引物R1;E.tarda.F1和E.tarda.R1为根据迟缓爱德华菌FimA基因设计的上游引物F1和下游引物R1;所述沙门氏菌引物对应的PCR扩增片段大小为526bp,弗氏枸橼酸杆菌引物对应的PCR扩增片段大小为161bp,奇异变形杆菌引物对应的PCR扩增片段大小为396bp,迟缓爱德华菌引物对应的PCR扩增片段大小为330bp。
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