[发明专利]一种DNA序列模式的构建方法有效
申请号: | 201310358216.0 | 申请日: | 2013-08-17 |
公开(公告)号: | CN103400056B | 公开(公告)日: | 2017-04-12 |
发明(设计)人: | 倪莉;黄志清;郑蓉;林江宏 | 申请(专利权)人: | 福州大学 |
主分类号: | G06F19/20 | 分类号: | G06F19/20 |
代理公司: | 福州元创专利商标代理有限公司35100 | 代理人: | 蔡学俊 |
地址: | 350108 福建省福州市*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | 本发明涉及生物群体中特定DNA序列的表示方法,特别是一种DNA序列模式的构建方法,该方法对于特定的DNA序列,将研究涉及的生物种属或类群所有该DNA序列按照碱基兼并表示规则合并成一条DNA序列模式,这种合并可以在种、属或其它分类单位水平上进行的,也可以是针对特定的生物类群来进行的。该方法构建的DNA序列模式可以直观地展现出研究体系中生物种属或类群的序列特征,从而有利于生物群体特性的分析和研究。 | ||
搜索关键词: | 一种 dna 序列 模式 构建 方法 | ||
【主权项】:
一种DNA序列模式的构建方法,其特征在于:对于特定的DNA序列,将研究涉及的生物种属或类群所有该DNA序列按照碱基兼并表示规则合并成一条DNA序列模式,这种合并在种、属或其它分类单位水平上进行,或者是针对特定的生物类群来进行;DNA序列模式的构建步骤如下:步骤1:确定研究涉及的生物种属或类群;步骤2:根据研究需要选择特定的DNA片段,收集步骤1所述生物种属或类群的相应DNA序列;步骤3:将步骤2中收集到的DNA序列进行比对,剔除与其它序列明显不一致或错误的DNA序列;步骤4:根据研究需要在生物种属或类群水平上,将经步骤3剔除后的生物种属或类群的DNA序列按照碱基兼并表示规则合并为一条DNA序列,并进行必要的校对,从而获得研究涉及的生物种属或类群的DNA序列模式。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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