[发明专利]DNA序列的数据分析有效
申请号: | 201380008411.9 | 申请日: | 2013-02-07 |
公开(公告)号: | CN104272311B | 公开(公告)日: | 2018-08-28 |
发明(设计)人: | L·萨斯特里-登特;S·斯里拉姆;N·埃兰戈;Z·曹;K·N·穆瑟兰曼 | 申请(专利权)人: | 陶氏益农公司 |
主分类号: | G06F19/18 | 分类号: | G06F19/18 |
代理公司: | 北京坤瑞律师事务所 11494 | 代理人: | 吴培善 |
地址: | 美国印*** | 国省代码: | 美国;US |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | 提供了用于数据分析的系统和方法。在一实施方案中,提供了一种分析方法,包括:电子接收序列数据;电子接收一个或多个与至少一个表达载体相关的参比数据序列;将所述序列数据与所述参比数据序列中的至少一个关联以鉴定转基因侧翼序列;在基因组中搜索所述转基因侧翼序列的一个或多个插入位点;以及当在所述搜索步骤中找到一个或多个插入位点时,注释所述基因组及该基因组内的所述一个或多个插入位点。 | ||
搜索关键词: | dna 序列 数据 分析 | ||
【主权项】:
1.一种分析方法,包括:电子接收序列数据;电子接收一个或多个至少与表达载体相关的参考数据序列,所述一个或多个参考序列数据选自下组:衔接子、引物、和克隆载体;将所述序列数据与至少一个所述参考数据序列关联而为该至少一个参考数据序列中的每一个参考数据序列确定位置;响应于该至少一个参考数据序列中每一个参考数据序列的被确定的位置鉴定出转基因侧翼序列;对基因组搜索该鉴定出的转基因侧翼序列,以确定该转基因的一个或多个插入位点中每一个插入位点的位置;和当在所述搜索步骤中找到所述一个或多个插入位点中每一个插入位点的被确定的位置时,注释所述基因组和所述一个或多个插入位点,并提供包括所述注释的注释数据用于进一步分析和/或可视化。
下载完整专利技术内容需要扣除积分,VIP会员可以免费下载。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于陶氏益农公司,未经陶氏益农公司许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
本文链接:http://www.vipzhuanli.com/patent/201380008411.9/,转载请声明来源钻瓜专利网。
- 上一篇:用于可再充电镁离子电池的铟-锡二元阳极
- 下一篇:亲水性等离子体涂层
- 同类专利
- 专利分类
G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
- 数据显示系统、数据中继设备、数据中继方法、数据系统、接收设备和数据读取方法
- 数据记录方法、数据记录装置、数据记录媒体、数据重播方法和数据重播装置
- 数据发送方法、数据发送系统、数据发送装置以及数据结构
- 数据显示系统、数据中继设备、数据中继方法及数据系统
- 数据嵌入装置、数据嵌入方法、数据提取装置及数据提取方法
- 数据管理装置、数据编辑装置、数据阅览装置、数据管理方法、数据编辑方法以及数据阅览方法
- 数据发送和数据接收设备、数据发送和数据接收方法
- 数据发送装置、数据接收装置、数据收发系统、数据发送方法、数据接收方法和数据收发方法
- 数据发送方法、数据再现方法、数据发送装置及数据再现装置
- 数据发送方法、数据再现方法、数据发送装置及数据再现装置