[发明专利]一种大批量开发苎麻基因组SNP标记的方法及其开发的引物有效
| 申请号： | 201410450212.X | 申请日： | 2014-09-05 |
| 公开（公告）号： | CN104212898A | 公开（公告）日： | 2014-12-17 |
| 发明（设计）人： | 陈建华;栾明宝;王晓飞;许英;孙志民;刘晨晨 | 申请（专利权）人： | 中国农业科学院麻类研究所 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68;C12N15/11 |
| 代理公司： | 长沙市融智专利事务所 43114 | 代理人： | 袁靖 |
| 地址： | 410205 湖*** | 国省代码： | 湖南;43 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种大批量开发苎麻基因组SNP的方法及其开发的引物；具体包括如下步骤：(1)提取2个苎麻品种的DNA；(2)利用RsaI酶对2个苎麻品种基因组进行酶切，获得214-314bp的小片段；(3)对酶切获取的小片段进行测序，获得SLAF标签；(4)针对2个苎麻品种获得的SLAF标签，根据等位基因数和基因序列之间的差异进行多态性分析，搜寻具有SNP多态性的SLAF标签；(5)对搜索到的SLAF标签进行引物设计，经过检测即为基因组SNP标记。相对于传统的开发分子标记方法，方法易行，操作简便，效率高，成本低。大批量苎麻基因组SNP标记的获得，为苎麻分子生物学和遗传学奠定了坚实基础。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 大批量 开发 苎麻 基因组 snp 标记 方法 及其 引物 | ||
【主权项】：
一种大批量开发苎麻基因组SNP标记的方法，其特征在于，具体包括如下步骤：(1)提取2个苎麻品种的DNA；(2)将苎麻基因组DNA酶切为小片段；(3)对酶切后获取的小片段进行测序，获得2个品种的SLAF标签；(4)在步骤(3)获得的2个苎麻品种的SLAF标签中，搜寻具有SNP多态性的SLAF标签；(5)对搜寻到的SLAF标签序列进行引物设计，经扩增测序检测，得到的引物即为基因组SNP标记。
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